Риба-даніо дає змогу бачити крізь шкіру, вся її інформація передається в дусі „відкритого доступу”, і з сьогоднішнього дня її генетична карта послідовно та упорядкована в Інтернеті. Ця тварина, набагато дешевша за гризунів, обіцяє підкорити лабораторії. Відео | Риба-меч "атакує" рибальський човен в Австралії
Згідно з інформацією esmateria.com, миша була королем лабораторії протягом багатьох років, але з'явився важливий конкурент. Гірка довжиною близько двох дюймів і з характерними поздовжніми смугами на тілі, що дає їй прізвисько: даніо. Її важливість у дослідженнях за останні роки збільшилася завдяки його умовам, які на сьогодні додаються до публікації у "Природі" двох вирішальних робіт, які подвоюють її цінність та вплив: його повний геном і цілий каталог мутантів-даніо, які будуть дуже корисні для того, щоб тягнути нитку до виявлення ліків від незліченних нездужань людини.
Ця риба має багато переваг перед іншими лабораторними тваринами, такими як миші, кури та мухи. Він прозорий, що дозволяє без проблем візуалізувати еволюцію експериментів; відкладає відразу більше півтисячі яєць, що генерує більшу статистичну здатність з меншими зусиллями; і він стає ембріоном всього за 24 години, що дає змогу отримати безцінну економію часу. "Хороший, приємний і дешевий", принесений до лабораторії. І це також прозоро в переносному сенсі, оскільки спільнота, яка працює з ним, вільно ділиться своїми результатами в Інтернет-сховищах з найкращим духом відкритого доступу. Ще більш прозорий на сьогодні, з його повним посібником з генетичних інструкцій, доступним кожному.
Але для того, щоб ці експерименти були справді корисними, йому потрібна була хороша карта свого геному та його подібності до людей. До сьогодні він публікувався потроху, більш-менш консолідованими фрагментами, але робота, опублікована Nature, має надзвичайно корисну якість та деталі. "Цей геном бореться вже 12 років", - резюмує іспанський дослідник Карлос Торрожа, один із підписантів цього дослідження, координованого Інститутом добровільного довіри Сангер. Торрожа пояснює, що це почали робити так, ніби це було людиною, і це було "неможливо реконструювати".
"Методи та інфраструктури, що використовуються в геномі людини, не варті того", - запевняє дослідник з Національного центру серцево-судинних досліджень (CNIC), який приєднався до кінця проекту, розпочатого в 2001 році, щоб спробувати змінити порядок усіх секвенували шматки так, що "Вони будуть добре виглядати". Тому від його роботи залишилося дві спадщини: сам метод упорядкування геномної карти та детальний геном даніо. Зараз ми знаємо, що даніо і люди діляться 70% генетичної інформації та понад 80% генів, відповідальних за хвороби людини.
Крім того, цю роботу доповнює каталог мутантів, який широко розробляється в лабораторіях Інституту Сангера. Йдеться про мутацію всіх генів риб, по черзі, щоб побачити, як ця мутація змінює її анатомію, фізіологію чи поведінку. Там вони пояснюють це так, ніби щоразу видаляють іншу частину автомобіля, щоб побачити, що сталося, і таким чином визначити його корисність. Замість того, щоб випадково викликати мутації, вони пропонують скласти повний каталог можливих мутантів для всіх об'єктів, які дає даніо.
Мутантний акумулятор
"Ця батарея мутантів дозволить створити моделі захворювань людини, які допоможуть провести попередні дослідження", - каже Торрожа. Як він пояснює, відтепер даніо буде дуже корисним для скринінгу терапії, тестування бібліотек наркотиків у незалежних рибних резервуарах з мутованими зразками для імітації захворювань людини, таких як травми спинного мозку або ожиріння.
Або, наприклад, робота, яку проводить дослідник Берта Альсіна з Університету Помпеу Фабра, щоб зрозуміти механізм регенерації вушних клітин - здатність, яку мають даніо, але ссавці втратили в процесі еволюції. "Цей геном є значним вдосконаленням. Вони записували його протягом багатьох років, але зараз він ідеальний, що послужить для швидшого та ефективнішого виконання роботи", - говорить Альсіна, яка також вивчає формування органів, завданням якого є це легше зробити.вчитися у прозорих ембріонах, таких як даніо.
"Це дозволяє нам проводити живі дослідження. Наприклад, побачити, як ракові клітини змінюють свій статус. Ви можете бачити зовні, які ліки гальмують їх розвиток, і слідкувати за ними, не втручаючись, і набагато дешевше, ніж за допомогою миші ", запевняє Альсіна. Цей дослідник наголошує на інших перевагах даніо (іспанські дослідники також згадують це англійською мовою), таких як солідарність наукової спільноти, яка працює з цією твариною, та покликання відкритого доступу до своїх досліджень. "Все спільно, риба без проблем приходить і їде", - жартує він. І додає: "Ми можемо дозволити собі замовляти мутантів за ціною державної установи, а не приватної компанії, що робить роботу ще дешевшою".
Переваги `` даніо ''
Все, що було опубліковано про його геном, одразу доступне в Інтернеті, і цей якісний стрибок від Природи не менший. Участь у міжнародних конгресах (які чергуються між Європою та США) за кілька років подвоїлася; наступний буде в липні в Барселоні. "Потрібно лише розрекламувати його переваги, щоб про нього більше знали на клінічному рівні, де це було б дуже корисно. Фармацевтичні компанії повинні почати класти трохи риби поруч з мишами", запевняє Альсіна.
Хосе Луїс Гомес-Скармета, з Андалузького центру розвитку біології розвитку, погоджується з нею і роками працює з цими тваринами. "Набагато дешевше вивчити будь-яку хворобу чи ліки в ембріональному розвитку даніо. І якщо є якісь підтвердження, зробіть стрибок до миші. Виконання попереднього скринінгу дозволить заощадити пасовище та багато часу порівняно з дні даніо ", захищає. "Він дуже генетично гнучкий, дуже швидко розробляється і дуже дешевий. Порівняння немає".
Логічно, що ця риба має менший генетичний розвиток з людьми, ніж миші, тому ніхто не має наміру виключати гризунів, а навпаки, доповнювати їх використання в більш початкових дослідженнях. "Хребетні дуже схожі в ембріональній фазі, що у даніо досягається менш ніж за два дні. Крім того, тепер геном можна дуже легко редагувати, щоб шукати аналогії з людьми", - говорить цей дослідник CSIC.
Гомес-Скармета претендує на постать Крістіани Нюслейн-Вольхард, яка почав працювати з даніо на початку 1990-х років після багатьох років роботи з мухою. Нобелівська премія з медицини в 1995 році, через рік написав щось на зразок фундаментального трактату про роботу з даніо в монографії для журналу "Розвиток". Того року було опубліковано 236 статей про даніо, згідно з пошуковою системою PubMed для наукових досліджень. Торік за цим самим сховищем було опубліковано 2111.