Риба-даніо дозволяє бачити крізь шкіру, вся її інформація передається в дусі «відкритого доступу», і з сьогоднішнього дня її генетична карта послідовно та упорядкована в Інтернеті. Ця тварина, набагато дешевша за гризунів, обіцяє підкорити лабораторії
Риби даніо ледве зростають два сантиметри./Genome Research Limited
Миша була королем лабораторії протягом багатьох років, але з'явився головний конкурент. Гірка довжиною близько двох дюймів і з характерними поздовжніми смугами на тілі, що дає їй прізвисько: даніо. Її важливість у дослідженнях за останні роки збільшилася завдяки його умовам, які на сьогодні додаються до публікації у "Природі" двох вирішальних робіт, які подвоять її цінність та вплив: її повний геном та цілий каталог риб. Мутантна зебра, яка будьте дуже корисними, тягнучи нитку до пошуку ліків для незліченних людських недуг.
III У ЦІХ НОВИНАХ
Ця риба має багато переваг перед іншими лабораторними тваринами, такими як миші, кури та мухи. Він прозорий, що дозволяє без проблем візуалізувати еволюцію експериментів; відкладає відразу більше півтисячі яєць, що генерує більшу статистичну здатність з меншими зусиллями; і він стає ембріоном всього за 24 години, що дає змогу отримати безцінну економію часу. "Хороший, гарний і дешевий", принесений до лабораторії. І це також прозоро в переносному сенсі, оскільки спільнота, яка працює з ним, вільно ділиться своїми результатами в Інтернет-сховищах з найкращим духом відкритого доступу. Ще більш прозорий на сьогодні, з його повним посібником з генетичних інструкцій, доступним кожному.
Риби даніо та люди діляться 70% генетичної інформації та понад 80% генів, відповідальних за захворювання
Але для того, щоб ці експерименти були справді корисними, йому потрібна була хороша карта свого геному та його подібності до людей. До сьогодні він публікувався потроху, більш-менш консолідованими фрагментами, але робота, опублікована Nature, має надзвичайно корисну якість та деталі. "Цей геном бореться вже 12 років", - резюмує іспанський дослідник Карлос Торрожа, один із підписантів цього дослідження, координований Інститутом довіри "Welcome Trust Sanger". Торрожа пояснює, що це почали робити так, ніби це було людиною, і це було "неможливо реконструювати".
"Методи та інфраструктури, що використовуються в геномі людини, були не вартими того", - каже цей дослідник з Національного центру серцево-судинних досліджень (CNIC), який приєднався до проекту, який розпочався в 2001 році, щоб спробувати змінити порядок усіх послідовностей. штук, тому "Вони будуть добре виглядати". Отже, від його роботи залишилося дві спадщини: сам метод упорядкування геномної карти та детальний геном даніо. Зараз ми знаємо, що даніо і люди діляться 70% генетичної інформації та понад 80% генів, відповідальних за хвороби людини.
Крім того, цю роботу доповнює каталог мутантів, який широко розробляється в лабораторіях Інституту Сангера. Йдеться про мутацію всіх генів риб, по черзі, щоб побачити, як ця мутація змінює її анатомію, фізіологію чи поведінку. Там вони пояснюють це так, ніби щоразу видаляють іншу частину автомобіля, щоб побачити, що сталося, і таким чином визначити його корисність. Замість того, щоб випадково викликати мутації, вони пропонують скласти повний каталог можливих мутантів для всіх об'єктів, які дає даніо.
Мутантний акумулятор
"Ця батарея мутантів дозволить створити моделі захворювань людини, які допоможуть провести попередні розслідування", - говорить Торрожа. Як він пояснює, відтепер даніо буде дуже корисним для скринінгу терапії, тестування бібліотек наркотиків у незалежних рибних резервуарах з мутованими зразками для імітації захворювань людини, таких як травми спинного мозку або ожиріння.
«Він дуже генетично гнучкий, дуже швидко розробляється і дуже дешевий. Порівняння немає », - каже дослідник
Або, наприклад, робота, яку проводить дослідник Берта Альсіна з Університету Помпеу Фабра, щоб зрозуміти механізм регенерації вушних клітин - здатність, яку мають даніо, але ссавці втратили в процесі еволюції. «Цей геном є значним поліпшенням. Вони записували це протягом багатьох років, але зараз він ідеальний, що послужить для швидшого та ефективнішого виконання роботи ", - говорить Альсіна, яка також вивчає формування органів, завдання, яке легше вивчати в прозорих ембріонах, таких як риба. зебра.
«Це дозволяє нам займатися навчанням у прямому ефірі. Наприклад, подивіться, як ракові клітини змінюють свій статус. Ззовні ви бачите, які ліки гальмують його розвиток, і слідкують за ним, не втручаючись, і набагато дешевше, ніж за допомогою миші », - запевняє Альсіна. Цей дослідник наголошує на інших перевагах даніо (іспанські дослідники також згадують це англійською мовою), таких як солідарність наукової спільноти, яка працює з цією твариною, та покликання відкритого доступу до своїх досліджень. "Все спільно, риба без проблем приходить і їде", - жартує він. І додає: "Ми можемо дозволити собі замовляти мутантів за ціною державної установи, а не приватної компанії, що робить роботу ще дешевшою".
Переваги `` даніо ''
Все, що було опубліковано про його геном, одразу доступне в Інтернеті, і цей якісний стрибок від Природи не менший. Участь у міжнародних конгресах (які чергуються між Європою та США) за кілька років подвоїлася; наступний - у липні в Барселоні. “Вам потрібно лише розрекламувати його переваги, щоб вона була більш відомою на клінічному рівні, де це могло б бути дуже корисним. Фармацевтичні компанії повинні почати класти рибку поруч з мишами ", запевняє Альсіна.
Хосе Луїс Гомес-Скармета, з Андалузького центру розвитку біології розвитку, погоджується з нею і роками працює з цими тваринами. «Набагато дешевше вивчати будь-яку хворобу чи ліки в процесі ембріонального розвитку даніо. І якщо є якесь підтвердження, перейдіть до миші. Здійснення попереднього скринінгу дозволить заощадити пасовище та багато часу порівняно з днями даніо ", - захищає він. «Він дуже генетично гнучкий, дуже швидко розробляється і дуже дешевий. Немає порівняння ".
Спинний вид ембріона трансгенної лінії даніо./Хосе Луїс Гомес-Скармета/CSIC-UPO
Логічно, що ця риба має менший генетичний розвиток з людьми, ніж миші, тому ніхто не має наміру виключати гризунів, а навпаки, доповнювати їх використання в більш початкових дослідженнях. “Хребетні дуже схожі в зародковій фазі, що у даніо досягається менш ніж за два дні. Крім того, тепер геном можна дуже легко редагувати, щоб шукати аналогії з людьми », - говорить цей дослідник CSIC.
Гомес-Скармата претендує на фігуру Крістіани Нюслейн-Вольхард, яка почала працювати з даніо на початку 1990-х років після багатьох років роботи з мухою. Нобелівська премія з медицини в 1995 році, через рік написав щось на зразок фундаментального трактату про роботу з даніо в монографії для журналу "Розвиток". Того року було опубліковано 236 статей про даніо, згідно з пошуковою системою PubMed для наукових досліджень. Торік за цим самим сховищем було опубліковано 2111.