Незважаючи на те, що ми неодноразово досягли успіху в міжнародному конкурсі, ми не пропустили кошти з єврофондів, говорить біохімік Йозеф Носек в інтерв’ю.
Словацькі вчені публікували в престижному журналі Scientific Reports. Використовуючи елегантну експериментальну стратегію, вони розкрили роль транспортних білків у клітинних мембранах. Проектом керував Йозеф Носек, очолював авторський колектив Андреа Циллінгова, обидва з природничого факультету Карлового університету в Братиславі. В інтерв’ю вони пояснюють суть своїх відкриттів, а також оцінюють фінансування науки у Словаччині.
Яке ваше дослідження?
Йозеф Носек (JN): Нас цікавить біологія дріжджів. В одному з наших проектів ми досліджуємо, як різні гідроксипохідні бензолу та бензойної кислоти впливають на їхні клітини. Ці прості ароматичні речовини дуже важливі для хімічної промисловості. Бензол сам по собі токсичний і має канцерогенну дію. З іншого боку, бензойна кислота зазвичай використовується як консервант у харчовій промисловості, оскільки вона перешкоджає росту багатьох мікроорганізмів, таких як гриби. Деякі з його похідних знайшли застосування в медицині (аспірин) та косметиці (парабени).
Найбільшим природним джерелом ароматичних речовин є лігнін, який є одним із найпоширеніших органічних полімерів у біосфері. Однак забруднення навколишнього середовища ароматичними сполуками значною мірою спричинене промисловістю. Бензольне ядро ароматичних молекул є хімічно відносно стабільним. Однак деякі мікроорганізми можуть розщеплювати його за допомогою ферментів і використовувати як джерело вуглецю та енергії для свого зростання в подальших біохімічних реакціях. До таких мікроорганізмів належать також деякі види дріжджів, з якими ми маємо справу в нашій лабораторії. Однак невідомо, як вони це зробили.
Йозеф Носек (1967)
вивчав генетику та молекулярну біологію в Університеті Коменського в Братиславі. Він пройшов кілька наукових досліджень у французьких університетах. Сьогодні він є професором біохімії на природничому факультеті Карлового університету. З 2001 по 2011 рік він працював міжнародним дослідником у Медичному інституті Говарда Хьюза в США. Разом із Любоміром Томашеком він заснував лабораторію кафедр біохімії та генетики, в якій вони вивчають біологію дріжджів.
Те, що ви виявили?
JN: Ми виявили гени, необхідні для метаболізму ароматичних сполук у дріжджах. Ми також досліджували зв’язок відповідних біохімічних реакцій із центральним метаболізмом еукаріотичних клітин (усі багатоклітинні організми в широкому розумінні складаються з еукаріотичних клітин. Вони більш складні за структурою і, як правило, більші за клітини прокаріотів) і те, як клітина контролює функції окремих генів. Ми дивуємось, як шляхи цих біохімічних реакцій зародилися в еволюції.
У нашій останній роботі в Scientific Reports ми виявили білки, які транспортують гідроксипохідні бензойної кислоти через плазматичну мембрану в клітину, де вони використовуються далі. Хоча такі білки були відомі з бактерій, вони довгий час не знаходились в еукаріотичних клітинах. Ми розробили стратегію пошуку двох із сотні транспортних білків у клітинах, що несуть гідроксибензоати. Результати наших досліджень принесли нові біологічні знання, але також показують, що дріжджі можна використовувати для виведення токсичних ароматичних речовин із навколишнього середовища.
Хоча більшість співавторів статті - словаки, ви очолювали міжнародну команду. Як для вас координували таку співпрацю?
JN: Наші дослідження вимагали співпраці експертів не тільки з різних галузей науки (біохімії, генетики, геноміки, мікробіології та інформатики), а й з різних європейських країн. Разом з Ігорем Земаном, Мартіною Небогачовою, Любомиром Томашеком у дослідженні також взяли участь наші докторанти та студенти факультету природничих наук Карлового університету, експерти Угорщини, Польщі та Іспанії.
В даний час міжнародне співробітництво є ключовим у наукових дослідженнях. Це дає змогу не лише обмінюватися ідеями та досвідом, а й спільним використанням науково-дослідної інфраструктури та ефективного використання коштів, які дуже обмежені, особливо в нашій країні. Ми давно знайомі з колегами з-за кордону, а також співпрацюємо над іншими проектами, тому координація роботи не була проблематичною. Я дуже радий, що кілька докторантів та студентів нашого факультету суттєво сприяли досягненню результатів. Окрім наукових результатів, наш проект також сприяв освіті молодих вчених і показав, що, незважаючи на проблеми, які маємо у Словаччині, хорошу науку можна зробити і в нашій країні.
Вгорі: Розташування амінокислотної послідовності білка-транспортера гідроксибензоату в цитоплазматичній мембрані клітини. Зліва: колонії дріжджів, що ростуть у чашці Петрі на середовищі гідроксибензоату. Справа: У дріжджовій клітині на малюнку білок-транспортер гідроксибензоату асоціювався з флуоресцентним білком, який світиться зеленим (GFP), і клітину спостерігали під флуоресцентним мікроскопом. Експеримент показує, що досліджуваний транспортер знаходиться в цитоплазматичній мембрані. Фото - архів Носека та Ціллінгови
Першим автором статті є Андреа Циллінгова, докторант кафедри біохімії. Чому ви вирішили навчатися на природничому факультеті Карлового університету і не поїхали за кордон?
Андреа Циллінгова (Змінного струму): Основною причиною, чому не поїхати за кордон, було те, що я не хотів залишати сім’ю та друзів, яких маю у Словаччині. Я вирішив вивчати біологію і факультет природничих наук, Карлів університет був найкращим вибором. Закінчивши магістратуру на кафедрі генетики, я вирішив присвятити себе науковій роботі, тому продовжив докторантуру, цього разу на кафедрі біохімії, але все ще в тій самій лабораторії, яка охоплює обидва ці робочі місця. Наукова робота обох кафедр є доказом того, що навіть у Словаччині можна виробляти якісну наукову роботу, яка є повністю конкурентоспроможною у порівнянні з іноземними. Я, звичайно, не шкодую про своє рішення залишитися в Словаччині.
Андреа Ціллінг (1988)
є докторантом Університету Коменського в Братиславі. Працює у спільній лабораторії кафедр біохімії та генетики Природничого факультету Карлового університету. У дисертації він досліджує метаболізм гідроксиароматичних речовин у дріжджах.
Ви подали заявку на отримання іноземного гранту або гранту, що фінансується за рахунок єврофондів?
JN: Понад десять років ми фінансували нашу лабораторію в основному за рахунок двох грантів Медичного інституту Говарда Хьюза, одного з найпрестижніших біомедичних установ у США.
Що стосується єврофондів, я був частиною команди дослідників з SAS та двох братиславських університетів, які готували проект. Тому я можу порівняти обидва досвіду. У випадку з грантами США проекти включали інформацію про керівника групи, результати на сьогоднішній день та пропозицію щодо плану дослідження, а критерії оцінки були чіткими та правильними. Для єврофондів науковий намір був лише незначною частиною заявки, і більша частина "проекту" повинна містити детальну специфікацію обладнання, яке ми планували придбати в лабораторіях.
Хоча ми неодноразово мали успіх у міжнародному конкурсі, ми не пропустили кошти з єврофондів через відсутність коштів, виділених у конкурсі. Однак при дурному адмініструванні ми без потреби втратили багато цінного часу, який ми могли б витратити на дослідження чи навчання наших студентів.
За останні роки ви неодноразово критикували систему освіти та фінансування науки у Словаччині. Як ви зараз дивитесь на цю проблему? Що б ви запропонували змінити?
JN: По суті, все те, що ми критикували в минулому з моїм колегою Любоміром Томашеком у журналах .týždeň (тут, тут і тут) та The Scientist, не змінилося і критикується і сьогодні. Я навіть відчуваю, що ситуація на даний момент ще гірша, ніж ми писали тоді.
Нинішня справа з розподілом єврофондів науці є парадоксальною, тим більше, що той факт, що ті, хто будував і використовував його роками, вже протестують проти цієї системи розподілу коштів. Протягом останніх тижнів було багато про що писано, і прокурори повинні бути більш інтенсивно залучені до обвинувачення, ніж самі вчені. Тим не менше, я не пробачу жодного порівняння. Бюджет Міністерства освіти на цей рік виділив 780 000 євро для всіх найкращих команд наших університетів. На противагу цьому міністерство планувало розподілити майже 600 мільйонів євро дивним компаніям для "стратегічних досліджень".
Система фінансування науки та досліджень у нашій країні спотворена, ми не можемо відрізнити якість від середньої
Більш розумний спосіб поділу єврофондів на науку нещодавно запропонував професор Ян Пішут (міністр освіти у 1990-х рр., Прим. Ред.). Він полягає в мінімізації впливу підконтрольних політикам посадових осіб та розпочатому розподілі грошей лише відповідно до якості дослідницьких груп. Це можуть бути, наприклад, такі групи, які вже пройшли оцінку Акредитаційної комісії або були визначені в Словацькій академії наук. Іншим рішенням може бути збільшення бюджетів грантових агентств VEGA (наукове грантове агентство Міністерства освіти та Словацької академії наук, прим. Ред.) Та APVV (Агентство з питань досліджень та розвитку), які відіграють ключову роль у фінансування наукових проектів та європейських грошей. може розпочати фінансування досліджень на європейському рівні.