ДОСЛІДЖЕННЯ
Анна Бош, координатор IDIBAPS Biobank, та Verónica Fernández, технічний координатор біорепозиторію CIBERDEM
Біорепозитарій діабету та метаболічних захворювань функціонує як змішана платформа CIBERDEM-IDIBAPS, яка інтегрована в IDIBAPS Biobank. Це науково-технологічна інфраструктура, яка координує збір, обробку, зберігання та передачу біологічних зразків для вдосконалення досліджень у галузі діабету та супутніх метаболічних захворювань. Анна Бош, координатор IDIBAPS Біобанку, та Вероніка Фернандес, технічний координатор Біорепозиторію CIBERDEM, представляють у цьому інтерв’ю баланс та прогноз цієї платформи.
-Однією із стратегічних дій CIBERDEM було сприяння створенню великого довідкового біорепозиторію зразків діабету та супутніх метаболічних захворювань. Наскільки просунувся цей проект та які проблеми залишаються для нього?
- Біорепозитарій CIBERDEM - це, мабуть, найповніша колекція біоресурсів метаболічних захворювань у Південній Європі, в основному орієнтована на діабет та ожиріння. На даний момент у ньому є зразки понад 11 000 донорів, як уражених деякою патологією, так і здорових людей контролю. Однією з особливостей цієї великої колекції є те, що вона також має широкий спектр клінічних, сімейних та епідеміологічних даних, чудово записаних та доступних науковому співтовариству, що дозволяють реалізувати великі проекти трансляційної медицини, яких важко досягти дослідницьких груп.
-Що означає наявність біорепозиторію CIBERDEM-IDIBAPS для діабету та метаболічних захворювань для дослідників CIBERDEM?
- Дослідники CIBERDEM мають у своєму розпорядженні цілий каталог зразків та даних безкоштовно. Той факт, що колекція вже доступна, означає, що дослідники не повинні витрачати час на планування та підготовку колекції своїх проектів, а можуть перейти безпосередньо до аналізу зразків.
-Скільки доступних зразків та тип зразків?
-У нас є широкий каталог метаболічних патологій, переважно різних типів діабету (тип 1, 2, гестаційний та моногенний) та ожиріння (ожиріння та патологічне ожиріння), як зазначено вище, але також дисліпідемія, переддіабетична популяція (дослідження PREDAPS), загальна контрольна популяція і специфічна колекція древньої ДНК. Так само ми маємо важливу колекцію зразків із загальної сукупності, включені до дослідження [email protected]. Донори зразків походять переважно з Андалусії, Каталонії, Валенсійської громади, Мадриду, Країни Басків та Ла-Ріохи, отримуючи загалом понад 50 000 зразків сироватки, плазми, ДНК та лімфоцитів.
-Як це працює і як управляють зразками?
-Центри, що співпрацюють, відповідають за підписання інформованої згоди донором, отримання зразка та запис відповідних даних. При необхідності обробка вихідного зразка також може бути проведена в місці збору (оскільки деякі процеси повинні проводитися негайно під час вилучення зразка). Згодом зразки надсилаються до Біобанку IDIBAPS, де буде проведена решта обробки, а біоресурси будуть зберігатися відповідно до найсуворіших критеріїв якості як в обробці зразків, так і в управлінні ними. Усі зразки зберігаються в декількох аликвотах та принаймні у двох різних місцях, щоб забезпечити якість зразків та уникнути втрат через потенційні інциденти.
-Загалом 13 центрів по всій Іспанії надають зразки, чи є вони відкритими для подальшої співпраці?
-Звичайно. Біорепозитарій CIBERDEM відкритий як для нових проектів, так і для створення нових центрів. У разі нових пропозицій Науковий комітет Біорепозиторію детально вивчить їх, щоб оцінити їх життєздатність.
-Який тип досліджень дає можливість мати ці зразки?
- Завдяки характеристикам колекції, яка включає велику різноманітність та кількість зразків, можна проводити великі дослідження, які були б неможливі завдяки діяльності окремих дослідницьких груп.
-Зразки супроводжуються клінічними та демографічними даними, які дозволяють проводити епідеміологічні дослідження. Які дослідження цього типу були розпочаті на основі цих зразків?
-Більшість аликвотних передач припадає на проекти дослідження [email protected], основною метою яких є вивчення епідеміології цукрового діабету типу 2. У цих дослідженнях були проаналізовані можливі біомаркери, пов’язані із захворюванням, генетичні та епігенетичні фактори. . у його розвитку, а також інші фактори, що представляють інтерес (наприклад, роль жирних кислот та фізичних вправ у розвитку хвороби).
-Також створена база даних BCGENE для інтеграції наявних даних з генетичними та геномними даними. Які переваги надає цей інструмент?
-База даних - це ще один ресурс, доступний для спільноти CIBERDEM, що дозволяє статистично використовувати епідеміологічні дані, пов’язані із зразками, на основі безлічі параметрів. За необхідності геномні дані, отримані за зразками, також можуть бути інтегровані.
-Зразки доступні будь-якому слідчому, який їх запитує. Чи користуються вони великим попитом?
-На даний момент, протягом 8-річної історії біорепозиторію, ми мали запити на зразки для понад 30 дослідницьких проектів. Більшість досліджень, що вимагали зразки, належать до середовища CIBERDEM, що є логічним, враховуючи, що мова йде про мережу, яка об'єднує найвизначніших дослідників на національному рівні в галузі метаболічних захворювань. Однак зразки біорепозиторію доступні для будь-якого дослідницького проекту, схваленого Зовнішніми комітетами Біобанку IDIBAPS та Науковим комітетом Біорепозиторію CIBERDEM.
-Який на сьогодні баланс наукової діяльності, що здійснюється за підтримки цієї змішаної платформи?
-Сальдо дуже позитивне, оскільки результати проектів, в яких використовувались зразки з Біорепозиторію, були опубліковані щонайменше у 15 високоефективних публікаціях.
-Чи існує також співпраця з дослідниками з інших тематичних областей CIBER?
-Не зараз, але це, безумовно, було б чудовою ставкою на майбутнє.