Нестандартні результати неінвазивного пренатального тесту на хромосомні розлади плода можуть надати додаткову інформацію про стан здоров'я вагітних

Анотація:

Ключові слова: неінвазивне пренатальне тестування, NIPT, вільна ДНК плода, хромосомні аберації, секвенування цілого геному, окультна злоякісність, системний червоний вовчак, СЧВ

пренатального

Вступ

Однак тести NIPT в основному містять геномну інформацію про вагітну жінку. Робота Bianchi та співавт. (7) вказує на виявлення десяти невстановлених випадків злоякісних новоутворень матері у вагітних у рамках надання комерційного тесту NIPT, що також було підтверджено під час подальшого клінічного ведення. Це пов’язано з тим, що злоякісні клітини виділяють ДНК у кровообіг, подібно до плаценти, а пухлинна тканина часто складається з клітин з множинними хромосомними абераціями. Однак злоякісність - не єдина можлива причина захоплення аномального профілю хромосом NIPT. У 2015 р. Чан та співавт. (8) зазначили, що системний червоний вовчак (СЧВ) також спричиняє множинні аберрантні хромосомні артефакти в аналізі цілого геному плацентарної ДНК. Ця робота вказує на захоплений випадок вагітної жінки з множинними хромосомними абераціями, що застосовується за допомогою тесту NIPT (9) з аналізом можливих причин. Ми сприймаємо здатність фіксувати інші відхилення, крім випробуваних, як головну перевагу підходу цілого геному при скринінгу NIPT.

Матеріал і методи

Врезультати

У першому NIPT-аналізі зразка ми отримали 6,9 мільйона парних зчитувань, які були однозначно зіставлені з геномом GRCh37. Виявлено позитивність до трисомії хромосоми 18 (Z бал> 6), і в той же час значення Z хромосом 21 і 13 знаходились у сірій смузі (Z бал від 2,5 до 4), що є нестандартним (малюнок 1). Результат після 2-го відбору проб був однаковим. За допомогою інструменту Circos ми оцінили розподіл зчитування у всіх аутосомах (малюнок 2). Ми спостерігали наявність множинних субхромосомних аберацій (мікроделецій та дуплікацій) на кожній з хромосом (малюнок 1). На підставі результатів пацієнтові показали амніоцентез.

Обговорення та висновок

Неінвазивні пренатальні тести на практиці показали високу чутливість та специфічність при виявленні найпоширеніших анеуплоїдних аналізів плоду вільної ДНК плода в периферичній крові вагітних. З оригінальної думки експертів з питань допологової допомоги, що використовує тест NIPT як альтернативу стандартному скринінгу для вагітних із підвищеним ризиком розвитку плоду з синдромом Дауна, бачимо перехід до доцільності використання тесту як першого варіанту скринінгу для найбільш загальні анеуплоїдії плода. Однак група тестів на основі сканування цілого геному може надати додаткову інформацію, яка стосується самої вагітної.

При проведенні тесту NIPT у нашій лабораторії ми зафіксували випадок вагітної жінки, який мав ненормальний результат тесту NIPT, і, візуалізуючи розподіл показників для всіх хромосом, ми спостерігали велику кількість субхромосомних аберацій (дублювання та делеції). Окультна злоякісність - одне з можливих пояснень отримання цього нестандартного результату.

Маса злоякісної пухлини може мати всі або субпопуляції клітин із субхромосомними абераціями, які виживають і розмножуються через порушення в механізмах контролю та відновлення клітини. Саме під час розпаду таких клітин аберрантна ДНК пухлини виділяється в кровообіг і, таким чином, змінюється відносна частка фрагментів в аберрантних областях. Кілька статей повідомляють про виявлення таких випадків прихованої злоякісної пухлини на ранній стадії в рамках НІПТ, які згодом були підтверджені, локалізовані та, можливо, проліковані при подальшому клінічному лікуванні (7).

Однак причиною виявленого аномального профілю також може бути СЧВ, і, незважаючи на поки недоступну інформацію з літератури, можна припустити, що інші аутоімунні захворювання можуть спричинити подібний результат. При спостереженні за аномальним профілем слід виключити СЧВ або інші аутоімунні захворювання у пацієнта. Однак пацієнт не повідомляв про СЧВ в історії хвороби.

В аналізованому випадку також повинна бути врахована третя альтернативна причина. Вагітна пройшла процедуру запліднення in vitro, тоді як імплантували два ембріони, один з яких не процвітав. Таким чином, один із ембріонів може бути джерелом аберантної ДНК, яку спостерігали в тесті NIPT.

Потрібні додаткові обстеження та додаткові анамнестичні дані, щоб остаточно визначити причину спостережуваного аномального профілю. Ключовим є результат аналізу зразка, отриманого в результаті амніоцентезу, завдяки якому можна буде виключити аберації, наявні у процвітаючому плоді. Через збір з внутрішньої сторони плодового міхура двійнята плода може виявитись неможливим визначити, чи походить аберрантна ДНК, захоплена в периферичній крові, з другого ембріона. Однак пацієнт відмовляється. Зразок плаценти, отриманий за допомогою CVS, та аналіз її каріотипу може бути підходящим методом для визначення ембріонального походження аберантної ДНК. Безумовно, проте, ембріональне походження абсорбуючої ДНК може бути підтверджене або виключене лише після закінчення вагітності відповідно до зникнення аберрантного сигналу. Перевірити гіпотезу про наявність СЧВ можна буде з історії хвороби пацієнта або за допомогою конкретних обстежень. За винятком попередніх причин, слід дослідити приховану злоякісність.

Висновок

Весь геномний підхід до неінвазивного тестування на найпоширеніші хромосомні розлади може бути важливим джерелом інформації про стан здоров'я вагітних і, таким чином, допомогти у виявленні серйозних патологічних явищ. Ми виявили випадок із множинними хромосомними абераціями з кількома можливими причинами, але для визначення їх необхідний відповідний алгоритм диференціальної діагностики.