Кафедра медичної мікробіології організаційно поділена на:
Національні довідкові центри:
- NRC для грипу,
- NRC для поліомієліту,
- NRC для менінгококів,
- NRC для морбілл, краснухи та паротидиту,
- NRC для моніторингу стійкості мікроорганізмів до антибіотиків,
- NRC для сальмонельозу,
- NRC для арбовірусів та геморагічної лихоманки.
Спеціалізовані лабораторії:
- Лабораторія молекулярної діагностики,
- Лабораторія клітинних культур,
- Лабораторія біобезпеки для біофакторів 3
Відділ забезпечення лабораторно-санітарної діяльності
- Центральна матеріальна квитанція,
- Підготовка культуральних середовищ та розчинів,
- Знищення інфекційного матеріалу та підготовка лабораторного посуду та медичного матеріалу до бактеріології,
- Знищення інфекційного матеріалу та підготовка лабораторного посуду та медичного матеріалу до вірусології,
- Санітарна робота в лабораторіях та інших районах відділу ЛМ.