Zdravotnícke noviny підготували інтерв’ю з MUDr. Петер Крижан, доктор філософії, медичний генетик, про можливості пренатальної діагностики у Словаччині. Цікаве читання про скринінгові резерви та відмінності між тестом TRISOMY та тестом TRISOMY test + доступне на нашому веб-сайті за згодою редакції.

Сьогодні ми можемо детально прочитати генетичну інформацію. Що може виявити поточний генетичний пренатальний діагноз? Які новини ми маємо у своєму розпорядженні та які ми збираємось повідомити? Ми також говорили про це з генетиком MUDr. Петро Крижан, к.с.н.

Як прогресувала пренатальна діагностика за останні роки?

Генетична пренатальна діагностика прогресує, як і всі інші генетичні методи. Роздільна здатність надзвичайно збільшується. Ми бачимо занадто багато того, що можемо назвати і практично використовувати.

Наприклад, на УЗД ми описуємо те, що бачимо, хоча іноді ми не можемо цього точно назвати. Тож ми можемо описати все, що бачимо і чого не просимо. Але зараз виникає питання, чи будемо ми якось використовувати побачене.

Донедавна в лабораторних методах, особливо в біохімії та гематології, ми задавали собі питання, на які відповідали або так, або ні. Наприклад, у пацієнта розвинувся патологічний глікемічний результат, так чи ні?

Подібне було з найсерйознішими захворюваннями в генетиці, коли ми запитали, чи є ця хвороба чи ні. Винятком був найбільш класичний метод, т. Зв каріотип, який у дуже грубій формі (колись дуже детальній формі) представляє всю генетичну інформацію людини, плода.

Це схоже на розробку електронних карт. Раніше у нас була проблема з розпізнаванням Братислави з Кошице, і сьогодні ми вже бачимо на картах номерні знаки автомобілів.

Тож як це працює сьогодні?

Сьогодні ми можемо прочитати генетичну інформацію детальніше. Ми можемо розглядати це як ультразвукове дослідження плода. Тож ми можемо ідентифікувати все, що бачимо, і іноді нам не потрібно це повністю розуміти.

І це величезна проблема на даний момент. Правильно інтерпретуйте те, що ми з’ясували під час експертизи. Тоді, коли ми почали розглядати хромосоми, позначені чорно-білими смужками, нас хвилювало, що якщо ми зможемо інтерпретувати їх усі та використати на практиці з такою кількістю комбінацій.

Однак сьогодні це звичка. Детальна діагностика недоступна у багатьох країнах світу, також з фінансових причин. На щастя, ми здійснюємо цю мрію разом з нами.

Таким чином, які захворювання може виявити поточна генетична пренатальна діагностика?

В даний час ми можемо підрахувати випадки, коли ми запитуємо про відомий діагноз у сім'ї, який ми потім виявляємо у плода, на пальцях руки. Таким чином, дитина спочатку повинна народитися з певним захворюванням, яке потім діагностується.

Ми повинні штучно встановити межі. Коли ми регулярно досліджуємо, наприклад, зразок плода чи дитини після народження, ми виявляємо багато змін. Деякі тонкі типи відмінностей обчислюються тисячами для кожного.

Однак є й такі зміни, які не піддаються інтерпретації. Тому ми повинні з достатньою мірою впевненості знати, що діагноз і знахідка пов’язані.

Наприклад?

очного

Наприклад, коли ми запитуємо, чи є у плода трисомія 21, і раптом ми виявляємо щось інше, чого ще ніхто не задавав, виникає питання, яке право ми маємо і за яких обставин сказати, що ми виявили щось інше.

Наприклад, що, якщо ми виявимо підозру на рак у вагітної жінки? Або підозра на вірус, який викликає СНІД ... Ми повинні носити або надягати «спеціальні окуляри», щоб бачити лише те, що просить спонсор, або ми повинні приймати справедливе рішення, коли і як повідомляти про ці інші висновки.

Коли ми виявляємо у плода дрібні речі, про які ніхто не запитував під час обстеження, нам доводиться пристосовувати окуляри, що з того, що теоретично можливо, ми не хочемо бачити, оскільки ще не знаємо, як це використовувати на практиці . Ми повинні мати готовий другий і третій кроки.

Наприклад, у разі виявлення пухлини ми також візьмемо інший зразок або застосуємо інший метод для підтвердження цього. Наступним кроком є ​​тлумачення того, що це означає для пацієнтки або для вагітної жінки та її плоду. На перший план вийдуть питання, чи справді ми можемо все дізнатись ...

Які методи неінвазивні при пренатальній діагностиці?

Наразі у нас є лише один неінвазивний пренатальний скринінговий тест, доступний у Словаччині, так званий Трисомічний тест. У світі існує лише кілька лабораторій, і одна з них знаходиться у Словаччині. У нас також є інші тести, але зразок необхідно відправити в лабораторію за кордон.

Лабораторні тести завжди мають певний компонент власної роботи, інакше вони складаються як лего. Отже, ми не робимо даний пристрій, наприклад, ми не змішуємо хімікати, ми купуємо все і робимо це за певною рекомендацією.

Частина цього процесу в тесті на трисомію є оригінальним, нашим, який не збирається із придбаних деталей. Оригінальна частина складається з оцінки. Результати, які дають пристрої, не можуть оцінюватися людським оком чи причиною, а якісними комп’ютерними програмами.

Читання даного коду повторюється десять мільйонів разів. На їх основі математична формула за допомогою комп’ютера повинна вирішити, чи є зразок підозрілим чи ні.

Як ви це дізнаєтесь?

Ми створили наші програми з біологами та експертами з біоматематики. Методи скринінгу, крім тестування ДНК, працюють з віком, є частиною розрахунку. Ми можемо перерахувати іспити як зростаючу тенденцію.

Якщо в методології нічого не зміниться і якщо середній вік вагітних зросте, це означатиме набагато більше показань до амніоцентезу. Якби натомість матері запропонували неінвазивний аналіз крові, кількість амніоцентезу можна було б зменшити до чверті або п’ятої.

Ми також можемо сказати, які типи результатів та у якому віці скринінг з крові матері надає інформації більше значення, ніж інші.

Неінвазивний пренатальний скринінговий тест на важкі трисомії плода (NIPT) існує в обігу вже більше року. Які ваші перші результати?

Цей тест стає стандартною частиною стратегій пренатального скринінгу та поступово впроваджується у розвинених країнах світу.

У наших лабораторіях було проведено валідаційне дослідження NIPT500, метою якого було визначити чутливість та специфічність NIPT як пренатального методу скринінгу для виявлення трисомій хромосом 21, 18 та 13.

З вересня 2015 року по червень 2016 року ми дослідили 474 зразки методом секвенування з низьким покриттям цілого геному. Вагітні жінки, яким пропонували участь у дослідженні відповідно до критеріїв, віддавали перевагу неінвазивному скринінгу перед вказаним інвазивним діагнозом після генетичного консультування.

Критеріями включення були вік 40 років і старші з фізіологічним скринінгом, прикордонним біохімічним скринінгом та патологічним ультразвуковим дослідженням. Для порівняння ефективності захоплення було використано контрольну групу з 1257 зразків вагітних жінок, обстежених на прохання вагітних за окрему плату, вказану переважно гінекологом.

При порівнянні результатів у двох моніторингових групах ми, як і очікували, виявили більшу частку зразків трисомії в групі NIPT500 - 3,2%, але також у контрольній групі було виявлено несподівано високу частку зразків з трисомією - 1,5%.

Ми розглядаємо загальне виявлення 2% трисомій у групі з низьким та прикордонним ризиком як підтвердження досвіду, що біохімічний та ультразвуковий скринінг трисомій має запаси у Словаччині.

Ви намагаєтеся розширити наш тест на трисомію на тест на трисомію +, який включатиме?

Це неінвазивний пренатальний скринінговий тест для визначення ризику найпоширеніших трисомій, статі, відхилень у кількості статевих хромосом та вибраних хромосомних мікроделецій плода з крові матері.

Він може виявити більше хромосомних розладів. Беручи до уваги вміст зразка плоду в крові матері та спосіб, яким ми розглядаємо стать плода через наявність чоловічих ознак, ми говоримо, що ми визначили ймовірну стать.

Наприклад, якщо жінка чекає двійнят, можна сказати, що принаймні одне з дітей буде хлопчиком.

Поширивши тест на трисомію, ми зможемо визначити стать або патологію на основі певної кількості X і Y хромосом при одноплідній вагітності. Ми також хотіли б розпочати з відомих захворювань, де ми маємо достатню впевненість, щоб розрізнити це гарантувати це.

На додаток до Т21, Т18 і Т13, виявлені синдроми включатимуть, наприклад, синдром Ді Джорджа, синдром Прадера-Віллі та Ангельмана, синдром Кри-дю-чата, синдром мікроделеції та синдром Вольфа-Гіршхорна.

Ми хотіли б продовжувати таким чином, ми хочемо поступово додавати відомі хвороби до тестування. Це розширення зору пренатального скринінгу на хромосомні дефекти. Ці тести еквівалентні частково скринінговим та частково діагностичним тестам.

Однак вони ще не випущені в якості діагностичних тестів. Якщо вони позитивні, їх також слід перевірити шляхом дослідження генетичного матеріалу плода, отриманого інвазивним методом, шляхом взяття навколоплідних вод або ворсин хоріона.

У наших біохімічних та ультразвукових скринінгів є деякі резерви?

Так, і їх кілька. Наприклад, у тому, що рекомендація МОЗ вимагає мінімуму. Отже, лікаря, який пропонує майбутній матері мінімальний, принаймні показовий тест, який охоплює найменш реальні випадки, не бракує.

Однак у ньому є тести, які в рази кращі. Він також несправедливо і не розуміє вік вагітної жінки. Це не береться як загальні дані в анамнезі чи підрахунках. Сьогодні свого роду міхур будується приблизно у віці матері.

Іншим застереженням є те, що ми використовуємо методи, які не настільки точні, як неінвазивний генетичний тест з крові матері. Крім того, вона єдина, яка працює з генетичним матеріалом генетичним методом.

Всі інші, такі як ультразвук, не дивляться на генетичний матеріал або хромосоми. У свою чергу, біохімія розглядає лише білки, ферменти, а не генетичний код.

Ви також працюєте над новим методом визначення фракції плода. Про що саме йдеться?

Якщо ми хочемо визначити каріотип, ми зазвичай працюємо з цілими кратними генетичного коду. В ядрі кожної клітини ми несемо цілу копію, всю інформацію.

Якщо ми досліджуємо плід з навколоплідних вод або крові матері, ми маємо нескінченну кількість копій зразка. Отже, код приблизно в десять мільйонів разів. Коли клітина руйнується, вона починає розпадатися на «частини», які потрапляють у кров вагітної жінки.

Частина генетичної інформації, фрагменти, що циркулюють у крові матері, тому належить плоду. Тому ми говоримо про неклітинну або вільну ДНК. Коли дитина народжується, мати не має ДНК у крові протягом декількох годин.

І нам потрібна ця проба, але якби хтось неправильно взяв її, зберігав чи транспортував протягом тривалого часу, від зразка фруктів не залишилося б нічого. Нам потрібно знати частку ДНК плода, щоб переконатися, що ми досліджуємо те, що ми маємо. Це один із показників якості.

Сьогодні ми знаємо лабораторний спосіб це з’ясувати. Однак ми натрапили на можливість розслідувати краще. Це новинка, яка пов’язана з дослідженнями. Отже, це щось середнє між клінічною практикою та дослідженнями.

У нас достатньо генетиків у Словаччині?

Це залежить від того, що ми просимо про них. Це надзвичайно вимоглива робота. Більшість експертів не знають більшості аспектів генетики протягом усього життя.

У нас достатньо генетиків з біологічною освітою, у нас обмежена кількість медичних генетиків, але більшість із них пенсійного віку.

Однак мова йде не лише про кількість, а й про якість освіти, навичок та, у випадку генетичної клініки, людський підхід. Це залежить від того, що ми просимо про них. Це надзвичайно вимоглива робота. Більшість експертів не знають більшості аспектів генетики протягом усього життя.