Він народився 10 вересня 1624 року, син заможного власника Винфордського орла на південному заході Англії. У віці 18 років він вступив до Магдалини Хол в Оксфорді, але незабаром кинув школу, щоб взяти участь у Громадянській війні в Англії як офіцер парламентської армії, що воює з королем. Нарешті він закінчив навчання в Оксфорді в 1648 р. За ступенем бакалавра. На початку цього року він був обраний членом престижного коледжу All Souls. Останній медичний ступінь він отримав через три десятиліття, в 1676 році, як відомий лікар у Пемброк-Холі в Кембриджі, куди на той час щойно вступив його старший син.
Вижили лише моменти його приватного життя. Після 1648 року він короткий час навчався, а потім повернувся на військову службу. У 1654 році він отримав 600 фунтів стерлінгів, подавши клопотання до Олівера Кромвеля про виплату грошей за своїх двох братів, які загинули в бою. У 1655 році він звільнився з коледжу All Souls і одружився на Мері Гіт, від якої мав трьох синів. Він оселився з родиною в Лондоні, де почав займатися близько 1656 року. Він отримав операційну ліцензію від Королівського коледжу лікарів у 1663 році, але він ніколи не мав більш тісних стосунків з Королівським медичним товариством, оскільки більшість його колег були недовірливими до його нових методів лікування та лікування.
Він пішов своїм шляхом, навряд чи під впливом спекулятивних теорій свого часу, але він також ігнорував епохальні відкриття своїх колег-лікарів. Він вважав анатомію та фізіологію марними, коли медичне мислення оновилося відповідно до цього.
Як практикуючий лікар, він робив усе для своїх пацієнтів, сумлінно доглядав за ними, відчував відповідальність за них і вчився зцілення біля ліжка. Він надавав великого значення ретельному спостереженню за пацієнтами і точному запису їх даних, тому чудово описав багато захворювань. Він спостерігав регулярні рецидиви деяких захворювань і пояснював принцип "геніальної епідемії", згідно з якою кожна епоха характеризується різною епідемією. Причину цього він бачив у зміні погоди, клімату, пір року. Він майстерно описав деякі стани, такі як подагра (від якої він сам страждав) та звіробій. Він розробив методологію написання історії хвороби. Він логічно доповнив ідею класифікації хвороб, підготувавши систематизацію лікувальних процедур (methodus medendi).
Він був одним із перших, хто описав - і відрізнив від кору - скарлатину, і першим пролив світло на природу істерії та танцю вітуса (хвороба Сиденхама). Він запровадив у медицині використання настойки опію (маку), одним із перших давав залізо людям, що страждають на анемію, і використовував хінін для лікування малярії. Гострі хвороби були похідними від зовнішніх причин, тоді як хронічні хвороби - від харчової вади, яка перешкоджала виведенню шкідливої речовини з організму. Він вважав природу своєю головною цілющою силою, вірячи в благотворний вплив свіжого повітря, фізичних вправ та використання природних рослинних матеріалів.
Його робота мала дуже значний вплив на розвиток медицини. Спираючись на свої практичні спостереження, він написав свою першу вражаючу роботу в 1666 році, свою книгу про лихоманку, яку він розширив у 1668 році, вивчаючи чуму. Третє, найширше і найвідоміше видання книги - Observationes Medicae (Медичні спостереження), було опубліковане в 1676 році і майже два століття служило базовою роботою практичної медицини. Його найкраща робота - дисертація про подагру (1683). У 1692 р., З додаванням сина, його остання завершена робота Processus Integri (Процес зцілення) з’явилася посмертно.
Хоча його праця привернула увагу таких відомих, просвічених сучасників, як фізик і хімік сер Роберт Бойл або філософ і лікар Джон Локк, його почали шанувати як батька англійської медицини та англійського Гіппократа лише після його смерті. Вперше його ім’я згадується в Медичному коледжі в 1727 році як суперника Гіппократу. Саме тоді була визнана його робота з відновлення шляхів зцілення та в інтересах етичної медицини.
Він помер у віці 65 років, 29 грудня 1689 р., У своєму домі в Лондоні. Його поклали на цвинтарі Сент-Джеймс. У 1810 році Медичний коледж встановив дошку на його честь.