МАДРІД, 23 червня (EUROPA PRESS) -

ожирінням

Ген, який раніше підозрювались чинити найбільший генетичний вплив на ожиріння людини, насправді не має нічого спільного з вагою тіла, підсумовує нове дослідження, проведене дослідниками Гарвардської медичної школи (HMS). English) та Дитячої лікарні Бостона, США.

Робота не тільки скасовує один з основних висновків про генетику ожиріння, але також надає перші ефективні способи аналізу "особливо нерозв'язних та заплутаних" частин геному, таких як локус цього гена, зазначає співавтор дослідження, Стівен МакКарролл, доцент кафедри генетики HMS.

Методи, викладені в статті, опублікованій у понеділок у журналі Nature Genetics, повинні допомогти вченим з'ясувати, чи пов'язані гени в подібних складних регіонах із хворобою, на думку дослідників.

Ген AMY1 кодує фермент, який допомагає людині перетворити крохмаль у цукор. Хоча інші ферменти також виконують цю функцію, AMY1 починає цей процес у слині. Саме це робить печиво солодким на смак, як тільки воно пролежало у роті досить довго.

Люди мають різну кількість копій гена AMY1 та різну кількість ферменту. "Існують певні припущення, що оскільки цей фермент допомагає отримувати поживні речовини з нашої їжі, це може бути пов'язано з ожирінням", - пояснює Крістіна Ашер, аспірантка лабораторії Мак-Керролл і перша автор статті.

Співавтор Джоел Гіршхорн, професор педіатрії в дитячій лікарні Бостона та професор генетики в HMS, вивчає генетичні варіанти, що впливають на ожиріння. Кілька років тому його цікавило, чи є AMY1 одним із генів, який відіграє певну роль.

Він проаналізував дані про асоціацію геномів, зібрані консорціумом GIANT, і не виявив взаємозв'язку між AMY1 та індексом маси тіла (ІМТ), мірою ваги людини щодо їх зросту. Але оскільки область геному була настільки складною, коли AMY1 коливався настільки широко (від двох до 14 або більше копій на людину), він не був впевнений, що його дані розповідають всю історію.

Він звернувся до МакКерролла, щоб побачити, чи зможуть вони об’єднатись, щоб відповісти на запитання. "Ми маємо досвід в галузі генетики ожиріння, і команда Стіва є експертом у цій різновиді складних варіацій", - говорить Гіршхорн. Гіршхорн зупинив проблему, поки лабораторія МакКерролла працювала над розробкою інструментів, які могли б виявити регіон, що містить AMY1. "Ця частина геному вийшла за межі можливостей генетики та молекулярної біології", - сказав МакКарролл.

Це не завадило вченим намагатися. У 2014 р. Відповідна міжнародна команда повідомила в “Nature Genetics”, що AMY1 має значний зв’язок із ожирінням. За даними дослідників, у людей з менше ніж чотирма копіями AMY1 ризик ожиріння був приблизно на 8 відсотків вищий, ніж у людей із дев'ятьма копіями. AMY1 здавався захисним.

Вони вважали, що дослідження Гіршхорна не виявило зв'язку, оскільки воно було розроблене для аналізу простих варіантів, що називаються SNP, а AMY1 був занадто складним. Тим часом команда МакКарролла розробила молекулярні та математичні стратегії для аналізу складних варіацій, таких як AMY1, і хотіла поглянути на результати іншої групи.

Використовуючи нещодавно розроблені молекулярні методи, Ашер отримав копії чисельних вимірювань AMY1 та оточуючих його геномних структур у безпрецедентних деталях. Потім він розробив статистичну структуру, щоб знайти основні закономірності, що пояснюють дані.

Спочатку регіон здавався "неймовірно складним", говорить МакКарролл. Але Ашер виявив, що широкий діапазон варіацій мав простіше пояснення: існувало дев'ять загальних форм AMY1, і більшість людей мали якусь комбінацію з двох.

Нові методи дозволили команді МакКарролла та Гіршхорна дослідити біологічне значення AMY1 з більшою точністю, ніж це було можливо раніше. І коли у них закінчився аналіз геномів близько 4500 європейців з діапазоном індексів маси тіла, AMY1 не мав ніякої зв'язку з вищим або нижчим індексом маси тіла.

Незважаючи на те, що визначення генів, пов'язаних із захворюванням, є вирішальним для профілактики та лікування, виключення генів також є важливим, на думку авторів. Дізнавшись, які гени варто відстежувати, допомагає запобігти марнотратству науковців на роки праці та інші ресурси. Оскільки інструменти для розуміння складних варіантів стають доступними, МакКарролл та Гіршхорн вважають, що на такі питання, як навколо AMY1, відповідатимуть легше.

"У геномі людини є сотні локусів із такою складністю. Вони були схожі на чорні діри в розумінні геному людини", - підкреслює МакКарролл. "Якби AMY1 був простим варіантом, було б дуже дивно побачити протилежні результати, подібні цьому. Ми створили найкращі практики для виявлення та підтвердження простих варіантів, але не для складних варіантів", - підсумовує Гіршхорн.