Мільйони років тому вид жаби розділився на два види. Через мільйони років дві жаби стали однією, але з кількома зайвими хромосомами через дублювання всього геному. Такий цікавий випадок африканської кігтячої жаби, Xenopus laevis, жаби, геном якої містить майже вдвічі більше хромосом, ніж відповідна західна кігтяста жаба Xenopus tropicalis. .
В процесі еволюції видів протягом мільйонів років відбувалися різні події, які збільшували кількість хромосом у деяких організмах. Поліплоїдія описує подію, яка збільшує кількість копій кожної хромосоми. Хребетні страждали щонайменше двома різними подіями поліплоїдії з моменту їх первісної дивергенції. Хоча сьогодні порівняно рідко можна спостерігати ссавців, рептилій чи птахів з аномальним числом хромосом, поліплоїдія поширена у риб, земноводних та рослин.
Професор Даніель Рохсар, професор генетики, геноміки та розвитку в Каліфорнійському університеті, Берклі та керівник відділу молекулярної генетики в Університеті Окінави Вищий інститут науки і техніки OIST, професор Масанорі Тайра з Токійського університету та професор Річард М. Гарланд з Каліфорнійського університету в Берклі під керівництвом груп дослідників вивчав еволюцію геному африканської жабі з пазурами. У цьому великому спільному проекті взяли участь вчені з різних університетів та установ у всьому світі. Опубліковано в "Природа" та розміщено на обкладинці, він виявив, що геном X. Laevis складається з двох різних наборів хромосом від двох вимерлих предків.
Доктор Олег Сімаков, докторський дослідник відділу молекулярної генетики OIST, розробив алгоритм для визначення періоду часу в мільйонах років між розбіжністю та подальшим злиттям родових видів X. Laevis. Для того, щоб обчислити ці часи, геном X. laevis повинен бути правильно анотований. Анотація включає визначення того, які ділянки ДНК містять кодуючі гени або некодуючі області. Хоча автоматизація може спростити цей процес, допускається багато помилок. Доктор Юрі Ясуока з підрозділу морської геноміки OIST допоміг вручну виправити генетичну анотацію. Його аспірантура в Токійському університеті під керівництвом професора Масанорі Тайра дозволила йому розвинути навички, необхідні для його ролі в цьому проекті: "Спираючись на свій досвід у галузі біології розвитку, я дослідив гени, що беруть участь у процесах розвитку ", - уточнив він.
Доктор Адам Сессіон, колишній аспірант в лабораторії професора Рохсара в Університеті Каліфорнії в Берклі та співавтор журналу Nature, висловив: "Найцікавішим висновком нашого дослідження є те, що ми можемо розділити потік Х Левіса геном на двох різних наборах хромосом, кожна з яких походить від унікальних предків. Хоча дослідження рослин змогли продемонструвати подібні результати, використовуючи споріднені види, які все ще існують, це дослідження вперше проводиться з двома батьківськими видами, що вимерли ".
Цей великий спільний проект призвів до нового розуміння дублювання геному, яке можна застосувати до еволюційних досліджень інших організмів. "Оскільки X. Laevis - це добре вивчена модельна система для клітинної та біологічної розвитку, ідеально вивчити вплив поліплоїдії на еволюція ", - пояснює доктор Сімаков.