• Про наш університет
    • Привітання ректора
    • Лідери
    • Організаційна структура
      • Організаційна структура BME
      • Сенат, комітети сенату, рада ректорів
      • Карок
      • Центр вищої освіти та промислового співробітництва
      • Сервісні організації
      • Спілка працівників вищої освіти
      • Рада державної служби
      • Студентське та докторантське управління
    • Доступність
    • Минуле та історія університету
    • Наша досконалість
      • Нобелівські лауреати
      • Академіки
      • Почесні громадяни
      • Почесні лікарі
      • Професори промисловості, професори Янош Нойман
      • Олімпійці
    • Факти і цифри
    • BME у міжнародних та вітчизняних рейтингах
    • Захист даних
    • Заявки на роботу
    • Документи
      • Установчий договір
      • Організаційно-оперативний порядок
      • Положення, інструкції, циркуляри
      • План інституційного будівництва
      • Звіт про контроль BME
      • Бюджет BME на 2019 рік
      • Постанови сенату
      • Інституційна акредитація 2014 р
  • Новини
  • Карок
    • Будівельний факультет (ÉMK)
    • Машинобудівний факультет (ГПК)
    • Архітектурний факультет (ÉPK)
    • Факультет хімічної та біоінженерії (ВБК)
    • Факультет електротехніки та інформатики (ВІК)
    • Факультет транспорту та транспортного машинобудування (KJK)
    • Факультет природничих наук (TTK)
    • Факультет економіки та соціальних наук (GTK)
  • Канцелярія
    • Інтранет
    • Канцелярія
    • Новини
    • Дані, що становлять суспільний інтерес
    • Проекти
    • Подія та спілкування
  • Освіта
    • Для рекрутерів
    • Базові курси (Bprof, BSc, BA)
    • Ступінь магістра (MSc, MA)
    • Докторські курси (PhD, DLA)
    • Нерозділене навчання
    • Спеціалізоване навчання
    • Університетські та міжфакультетські курси
    • Курси іноземних мов
    • Освіта дорослих
    • Інститут постійної техніки BME
    • Управління талантами
  • НДДКР
    • Дослідження та розробки та інновації в BME
    • Проекти
    • Програми досконалості
      • Запуск програм
        • Тематична програма досконалості
        • Нова національна програма досконалості
          • ПНР 2020
          • ПНР 2019
          • ПНР 2018
          • ПНР 2017
          • ПНР 2016
      • Закриті програми
        • Програма досконалості інституцій вищої освіти
        • Дослідницька університетська програма
    • Дослідницький грант CELSA
      • CELSA 2021
      • CELSA 2020
      • CELSA 2019
      • CELSA 2018
      • CELSA 2017
    • Центр вищої освіти та промислового співробітництва
    • Міст - бюро технологій та передачі
    • Центри знань
    • Наукові програми
  • Міжнародні зв'язки
  • Університетське життя
    • Програми
    • Культура
    • Університетські клуби
    • Спорт
    • Коледжі
    • Професійні коледжі
    • Студентська комісія з закордонних справ
    • Університетські та викладацькі журнали
    • Випускники
  • Натисніть
    • BME в пресі
    • прес-релізи
    • Бібліотека фото та відео
    • Медіа-комплект, елементи фірмового стилю
    • Публікації

24 серпня 2017 р.

Створена перша карта взаємодії 250 найпоширеніших захворювань в Угорщині, для якої дослідники BME VIK вивчили дані майже ста двадцяти тисяч людей.

"Ми вже два десятиліття повільно звертаємося до методів у галузі штучного інтелекту, машинного навчання, біоінформатики та біостатистики, з яких байєсівські, системні підходи стали ключовими в нашій публікації щодо картографування від хвороби до хвороби", - сказав він. Антал Петер, Доцент кафедри вимірювань та інформаційних систем факультету електротехніки та інформатики, який був одним із авторів нещодавньої статті в PLOS Computational Biology, що представляє спільну роботу дослідників з Технологічного університету, Університету Земмельвейса та Університету ім. Манчестер.

взаємозв

В результаті т. Зв мультиморбідність, тобто карта, що відображає взаємодію різних захворювань, що показує системні взаємозв’язки між 250 найпоширенішими захворюваннями. Інтерфейс може бути корисним для лікарів, дослідників наркотиків або непростих людей.

Дослідження базувалося на наборах даних, що містять детальну інформацію про стан здоров’я від великої кількості учасників з Біобанку Великобританії. На сьогоднішній день Великобританія Біобанк є найбільшою у світі базою даних із півмільйона учасників, включаючи повний генетичний профіль учасників, а також інформацію про минулі чи нинішні захворювання, вживання наркотиків та звички життя, а також дані про конкретні захворювання для деяких підгруп. Дослідницька група була уповноважена використовувати цю інформаційну базу попередньою заявкою.

База даних містить дані добровільних учасників, дані яких захищені системою кількома способами. "Багато інших дослідницьких груп беруть участь в аналізі даних, але UK Biobank дуже обережно, щоб вчені отримували інформацію лише про сферу їх застосування і могли вивчати лише ті проблеми, які були визначені раніше", - сказав Петр Антал.

У цьому аналізі були використані дані майже 120 000 учасників депресії. “Нашим завданням було спробувати відобразити зв'язок депресії з усіма іншими захворюваннями. Ми створили модель системи, в якій стало зрозуміліше, як окремі захворювання, такі як депресія, ожиріння, стрес або мігрень, взаємодіють безпосередньо », - сказав Петр Антал.

З тисяч відомих хвороб багаторазовий скринінг дав 250 найпоширеніших захворювань у базі даних, які можна було б використовувати для такого загальносистемного аналізу.

Він зіграв ключову роль у роботі Пітер Маркс докторант, інший співавтор видання BME, член дослідницької групи під керівництвом Петера Антала. «Обстеження на захворювання було справжнім випробуванням, оскільки всі дані надходили до нас закодованими. Наприклад, ожиріння довелося включати в систему на основі інформації про індекс маси тіла, оскільки воно не було включено в дані як окреме захворювання ».

Після очищення інформації розпочався багатопотоковий аналіз. Одним із особливих завдань Пітера Маркса було включення системи кодів хвороб, що використовується у Великобританії, до міжнародної системи коду. Необхідну медичну базу надали експерти Університету Земмельвейс, співавтори публікації Дьєрдь Багді та Габріелла Юхас.

"Так звані за допомогою методу, заснованого на моделях графіків ймовірностей, нам вдалося відфільтрувати непрямі наслідки попарних зв'язків захворювань », - нагадав Петр Маркс. «Це була найбільша робота: мені довелося проводити багатоденні обчислення на машині та порівнювати та інтерпретувати результати. Нарешті, було 320 статистично підтверджених асоціацій між вузлами 250 захворювань, розділених на 18 груп, які пов’язують захворювання між собою. Результати нашого методу можуть бути застосовані не тільки до пар хвороб, але і до груп захворювань, ми можемо вивчити до чотирьох або п'яти захворювань разом ».

Видання містить контактні дані безкоштовної пошукової системи, в якій брав участь Петр Маркс. Веб-сайт розміщений на серверах Департаменту вимірювальних та інформаційних систем, але. В інтерактивному інтерфейсі ви можете вводити різні змінні, такі як пари або групи захворювань, у засобі перегляду карт, що відображають мережі захворювань. Поєднуючи та фільтруючи змінні, ми можемо отримати відповідь щодо того, чи можлива пряма взаємодія на рівні хвороби між декількома захворюваннями.

Наприклад, карта депресії з високою депресією є хорошим свідченням того, що це захворювання в першу чергу тісно пов'язане з іншими психічними захворюваннями, але також пов'язане з ожирінням та деякими фізичними захворюваннями. Однак його зв’язок з діабетом не є більш прямим, але частіше зустрічається у людей з депресією через ожиріння.

Статистичне підтвердження зв'язку між кожним захворюванням позначається товщиною лінії, що з'єднує назви. "Поточне обмеження полягає в тому, що ці рядки не показують, наприклад, забарвленням, чи мають стосунки позитивний чи негативний ефект", - зазначив Петер Антал. «Дивовижним науковим відкриттям останніх років стала зворотна супутня патологія, а саме те, що наявність деяких захворювань зменшує ймовірність виникнення інших захворювань. Це також є одним із напрямків наших майбутніх досліджень, але найважливішим поточним завданням є повні генетичні дані проекту, доступні з травня. Відтепер можна було завантажити 10 терабайт генетичних даних від півмільйона учасників британського Біобанку, систематичне обстеження яких, разом із даними про хвороби, вживання наркотиків, вплив на навколишнє середовище та спосіб життя, є наступним великим викликом біоінформатики.