Джерело зображення, Thinkstock

коронавірус

Каналізація стала джерелом відповідного науково-дослідного матеріалу.

Це відкриття викликає багато запитань і може суттєво змінити те, що відомо на сьогодні про вірус, який викликає covid-19.

Дослідники щонайменше з чотирьох країн, включаючи Бразилію, виявили наявність нового коронавірусу у зібраних зразках стічних вод тижнів або місяців до цього першої офіційно зареєстрованої справи в китайському місті Ухань, яка вважається причиною поточної пандемії.

Але як ці відкриття фекальних вірусів впливають на те, що ми знаємо про вірус SARS-CoV-2?

Вчені вказують три основні осі:

  • Моніторинг: Виявлення у стічних водах може служити комплексним та недорогим інструментом для моніторингу прогресу covid-19. Існує щонайменше 15 країн, де ця стратегія була прийнята або вивчається.
  • Можливий ризик для здоров’я: наявність генетичного матеріалу вірусу в калі свідчить про те, що стічні води можуть бути шляхом зараження.
  • Походження пандемії: вірус, можливо, циркулював набагато раніше, ніж зазначено в офіційній хронології.

Щодо третього пункту, дослідження, яке привернуло найбільшу увагу, було проведене дослідниками з Університету Барселони.

Кінець Можливо, ви також зацікавлені

За їх словами, новий коронавірус був присутній у заморожених зразках, зібраних в Іспанії, з 15 січня 2020 року (за 41 день до першого офіційного повідомлення про зараження в країні) та з 12 березня 2019 року (за дев'ять місяців до першого випадку повідомляється в Китаї).

Але,як міг циркулювати вірус, який може спричинити пандемію, не привертаючи уваги або створити вибух справ, як це сталося в Ухані?

Експерти наводять щонайменше п’ять гіпотез.

Одне з них полягає в тому, що пацієнти могли отримати неправильні або неповні діагнози респіраторних захворювань, що могло б сприяти початковому поширенню хвороби.

Джерело зображення, Getty Images

Експерти вважають, що перший спалах нового коронавірусу виник в Ухані.

Іншим є те, що вірус поширився недостатньо сильно, щоб викликати спалах.

Є також дві можливості проблем при аналізі- Можливе забруднення зразка або хибнопозитивний результат через генетичну схожість з іншими респіраторними вірусами або відмову тестового набору.

Нарешті, є ті, хто говорить про вірус, який чекає активації.

Том Джефферсон, епідеміолог, пов'язаний з Центром доказової медицини Оксфордського університету, сказав британській газеті The Telegraph що Зростає кількість доказів того, що SARS-CoV-2 був широко поширений до появи в Азії.

"Можливо, ми спостерігаємо прихований вірус, який активувався в умовах навколишнього середовища", - зазначив він.

Для Фернандо Спілкі, президента Бразильського товариства вірусологів, необхідно зачекати на нові дослідження на цю тему, перш ніж робити висновки щодо захворюваності вірусом за місяці до відомого походження пандемії, у грудні.

"Усі ці результати слід оцінювати з обережністю. Характеристика ГРВІ-CoV-2 для генерування випадків високого ступеня тяжкості та відносно високої летальності серед населення робить малоймовірним, що цей вірус буде циркулювати в регіоні без доказів клінічних випадків".

Знахідки в Бразилії

У Бразилії група під керівництвом дослідників з Федерального університету Санта-Катаріни (UFSC) проаналізувала шість зразків 200 мл заморожених стічних вод, зібраних у Флоріанополісі з 30 жовтня 2019 року по 4 березня 2020 року.

Джерело зображення, Getty Images

Недавні дослідження показують, що новий коронавірус також присутній у фекаліях пацієнтів.

Результат дослідження був відображений у статті, яка досі не була передана на огляд іншим науковцям, в якій вони вказують, що наявність вірусу було виявлено станом на 27 листопада.

За їхніми зразками, на літр стічних вод потрапляло 100 000 копій геному вірусу, одна десята від тієї кількості, яку було виявлено у зразку 4 березня. Санта Катарина офіційно зареєструвала перші два випадки захворювання 12 березня у Флоріанополісі.

За словами дослідників, вірус був ідентифікований у зразках стічних вод за допомогою тесту RT-PCR, здатного виявити наявність SARS-CoV-2, починаючи з 24 годин після зараження пацієнта. Цей тест в основному перетворює РНК вірусу (генетичний матеріал) у ДНК, щоб ідентифікувати її присутність у досліджуваному зразку чи ні.

"Це показує, що ГРВІ-CoV-2 розповсюджений у громаді за місяці до повідомлення про перший випадок"на американському континенті, пишуть автори статті.

Біолог Гіслейн Фонгаро, керівник дослідження та професор кафедри мікробіології, імунології та паразитології UFSC, заявив про перші результати вони викликали скептицизм в колективі.

З цієї причини вони зв’язались з іншими університетськими кафедрами, щоб зібрати та повторити всі тести з різними вірусними маркерами (що служить для запобігання забрудненню виявлення інших подібних вірусів).

За її словами, наявність вірусу за місяці до офіційної реєстрації можна пояснити, наприклад, тим, що люди вони можуть захворіти або не захворіти або приписували симптоми іншим хворобам.

Але, на думку Фонгаро, лише майбутні дослідження можуть пояснити, як діє вірус в листопаді опинився у каналізації Флоріанополіс.

Наприклад, генетичне секвенування вірусу, знайденого у стічних водах, можна порівняти з іншими подібними тестами, проведеними у всьому світі, щоб оцінити точну дату походження SARS-CoV-2.

Коли справді почалася пандемія?

Офіційна хронологія пандемії covid-19 з часом змінилася, оскільки ще багато чого можна дізнатись про хворобу, її поширення та, головним чином, походження.

Джерело зображення, Getty Images

За оцінками, перший спалах нового коронавірусу пов’язаний із вологими ринками Ухані, де продаються живі та мертві дикі тварини.

Поки незрозуміло, як і коли вірус SARS-CoV-2 почав заражати людський вид.

Серед учених існує єдиний погляд, що перший спалах стався на ринку Ухані продаж живих і мертвих диких тварин. Але дослідники не знають, чи з’явився там вірус, чи «використав» це місце для поширення від однієї людини до іншої.

"Якщо ви запитаєте мене, що, швидше за все, я кажу вам, що вірус походить з ринків, де продають диких тварин", - заявив ВВС Юен Квок-юнг, мікробіолог з Гонконзького університету.

Лагуни залишаються. Про перші випадки захворювання на covid-19 було офіційно повідомлено в кінці грудня, але дослідження лікарів в Ухані, опубліковане в січні медичним журналом The Lancet, виявив, що перший відомий випадок covid-19 у людини це сталося тижнями раніше.

Пацієнтом був літній чоловік з Ухані, який не мав зв'язку з ринком.

Графік пандемії в Бразилії також може змінитися.

Перший офіційний діагноз в країні стався 26 лютого. Йшлося про 61-річного бізнесмена, жителя Сан-Паулу, який повертався з поїздки до Італії, де починала з’являтися велика кількість справ.

Але аналізи, проведені дослідниками з Фонду Освальдо Крус (Fiocruz), виявляють це у Бразилії був принаймні один випадок SARS-Cov-2 за місяць до цього, між 19 і 25 січня.

Згідно з цим дослідженням, вірус також розповсюдився б серед жителів країни на місяць раніше, ніж передбачав федеральний уряд.

Джерело зображення, Getty Images

Є дані, що перша зараза в Бразилії сталася за місяць до офіційного виявлення хвороби.

Для досягнення цих висновків Фіокруз спирався головним чином на два елементи: ретроспективний аналіз зразків, відібраних у пацієнтів у попередні місяці, та порівняння між кількістю людей при респіраторних захворюваннях без видимої причини виявлено в 2020 році з попередніми роками.

Але як тоді можна подолати ці прогалини? Деякі експерти виступають за проведення досліджень методами старої школи.

"Ці спалахи повинні бути належним чином розслідувані з людьми на місцях, один за одним. Ви повинні робити те, що зробив Джон Сноу. Ви допитуєте людей і починаєте формувати гіпотези, що відповідають фактам, а не навпаки ", - сказав епідеміолог Оксфордського університету Том Джефферсон в інтерв'ю The Telegraph.

Джерело зображення, Британська бібліотека

Карта, зроблена Джоном Сноу для дослідження спалаху холери в Лондоні в 19 столітті.

Доктор Джон Сноу (1813-1858) вважається одним із засновників сучасної епідеміології. У 1854 році він вирішив розслідувати спалах холери, який вразив Лондон на місці. За попередні два десятиліття від цього захворювання загинули десятки тисяч людей у ​​цьому місті.

Сніг не прийняв найпоширенішої на той час теорії, згідно з якою зараження відбулося через "гниле і несвіже повітря".

У своєму знаменитому аналізі даних Сноу взяв інтерв’ю у жителів міста, започаткував картографування для кожного конкретного випадку, і в підсумку визначив, що причиною спалаху насправді є загальнодоступне джерело води, забрудненої відходами.

Відкриття спричинило революцію у дослідженнях поширення хвороб.

Чи можливе поширення ГРВІ-CoV-2 через стічні води?

Наявність нового феномена коронавірусу збільшує можливість зараження стічними водами.

Джерело зображення, Getty Images

Неочищені стічні води можуть скидати значне вірусне навантаження в річки.

У 2003 році, під час пандемії іншого вірусу SARS-CoV, зараження сотень мешканців тієї самої будівлі в Гонконзі було пов’язано з витоками каналізаційної труби.

У поточній пандемії досі немає доказів того, що це сталося або що передача ГРВІ-CoV-2 життєздатна після виведення з калом.

Також немає офіційних рекомендацій щодо використання відбілювачів для утримання зарази через стічні води, як це розповсюджується у групах WhatsApp. Забруднення відбувається переважно через дихальні шляхи.

Дослідження показують, що система очищення стічних вод може усунути присутність вірусу, але нестабільна санітарна ситуація в таких країнах, як Бразилія, може призвести до скидання великої кількості вірусного навантаження в річки без належного очищення.

За даними Національної інформаційної системи санітарії на 2018 рік, лише 46% стічних вод, що утворюються в Бразилії, належним чином очищаються.

Відсутність санітарії в цій країні призводить до понад 300 тисяч госпіталізацій на рік, але поки що не можна стверджувати, що присутність коронавірусу у стічних водах становить ризик для здоров'я населення.

ГРВІ-CoV-2 може з’являтися в калі до половини пацієнтів з COVID-19, включаючи тих, у кого була діарея, про симптом, про який повідомляє 1 з 5 пацієнтів.

Деякі дослідження вказують на те, що загалом вірус з’являється в калі приблизно через тиждень після появи симптомів і може залишатися ще протягом п’яти тижнів після одужання пацієнта.

Згідно з деякими дослідженнями, метод моніторингу присутності вірусу в каналізаційній системі міста дозволяє попередити про наявність спалаху за 7–10 днів до офіційного запису.

Однією з переваг цього підходу є те, що він також дозволяє спостерігати за пацієнтами без симптомів або без діагнозу.

Наприклад, у місті Белу-Орізонті пілотний проект Національного агентства водних ресурсів (ANA) аналізує зразки стічних вод і вказує, що кількість заражених може бути в 20 разів більшою, ніж офіційно підтверджених випадків.

Що ще можна проаналізувати в каналізації?

Кар'єра "епідеміолога стічних вод", яка поширилася за останні два десятиліття по всьому світу, за останні роки розширилася.

Джерело зображення, Getty Images

Хоча клінічні дослідження дозволяють вивчати окремі випадки, аналіз стічних вод служить для вивчення громад у цілому.

Однією з головних функцій цього професіонала є виявлення, наприклад, як Ви можете порівняти рівень незаконного вживання наркотиків оцінюється за допомогою традиційних методів, таких як анкетування, з найбільш прямими доказами, виявленими в каналізаційних системах. І таким чином перевірити, чи є серед інших відомостей підзапис.

Ця методика спрямована не на отримання інформації про конкретних осіб, а про населені пункти, що дозволило б попередити органи влади про ефективність кампаній та служб охорони здоров’я в певному регіоні, а також про те, чи належним чином використовуються поліцейські ресурси.

На додаток до вживання наркотиків, цей тип аналізу частинок стічних вод може бути використаний проаналізувати звички, пов’язані зі споживанням їжі та ліків.

Наприклад, лабораторія в Університеті Квінсленда, Австралія, проводила збір на очисних спорудах по всій країні для аналізу звичок вживання їжі та вживання наркотиків у різних громадах.

Результат? Загалом дослідники виявили, що чим багатша громада, тим здоровішим є її харчування.

У вищих соціально-економічних шарах споживання клітковини, цитрусових та кофеїну було вищим. У нижчих виявлено значне використання ліків, що відпускаються за рецептом.

З іншого боку, використання антибіотиків розподіляється досить рівномірно між різними соціально-економічними групами, що вказує на те, що державна система охорони здоров'я робить свою роботу.