Біологи ELTE працюють над розробкою методу, який, крім усього іншого, може сприяти розумінню розсіяної мієломи.

моніторингу

За їх результатами лікарі зможуть отримати більш точну картину наявності ракових клітин, тому вони зможуть легше вирішити, як довго і наскільки інтенсивно вони застосовуватимуть різні методи лікування до пацієнта.

У Центрі біотехнологічних вищих навчальних закладів та промислового співробітництва (FIEK) на факультеті природничих наук Університету Етвеша Лоранда студенти-студенти можуть брати участь у складних та точних базових наукових заходах, таких як ті, що замовляються промисловістю та просяться фармацевтичними компаніями.

Один із кандидатів докторантури докторської школи біології Університету Етвеша Лорана, Бенц Шикора, намагався долучитися до досліджень кафедри імунології Університету Етвеша Лоранда як студент під керівництвом керівника кафедри Імре Качковіча. Під час своєї докторської роботи - у співпраці з працівниками Університету Дебрецена - він першим в Угорщині випробував метод на мишах, який можна використовувати для аналізу різноманітності важливого компонента імунної системи, молекули антитіла, на рівні ДНК.

З подальшим розвитком нового методу можна буде спостерігати за пухлинними захворюваннями, пов’язаними з різними В-клітинами. Перший такий метод, який зараз знаходиться на експериментальній фазі, може полегшити лікування хворих на множинну мієлому.

«За допомогою так званого секвенування наступного покоління ми можемо дуже точно і дуже детально вивчити репертуари антитіл різних видів. За допомогою цього методу ми можемо визначити склад ДНК певної частини антитіла або молекули антитіла та послідовний порядок молекул, що складають сегмент ДНК », - сказав Бенц Шикора, перший автор нещодавньої статті, яка представляла дослідження.

Цей метод вже широко використовується в Угорщині для аналізу різних зразків ДНК, але секвенування нового покоління вперше було використано в ELTE для аналізу репертуару антитіл. Це було серйозною проблемою, оскільки на початку експериментів у нас не було достатнього досвіду для аналізу великої кількості генерованих даних. Цьому сприяла наукова група в Інституті фізики, також у FIEK, очолювана професором Іштваном Чабаєм. За допомогою одного з колег групи, докторанта Орсолії Піпек, було розроблено біоінформатичне підґрунтя, що мало важливе значення для точної оцінки результатів, а отже і для налаштування методу.

Дослідники ELTE використали метод секвенування нового покоління (NGS), щоб продемонструвати, що імунна відповідь трансгенних мишей, що надається ImmunoGenes Kft, генерує більш різноманітний репертуар антитіл, ніж у звичайної миші. Використовуючи цих мишей, ми з більшою ймовірністю виробляємо молекули антитіл належної якості та ефекту, що може бути дуже корисним у різних наукових дослідженнях і навіть у людській медицині.

Оскільки дослідження на мишах були успішними, пізніше до дослідження долучилися кілька студентів з Інституту біології Університету Етвеша Лорана, в яких антитіло, виділене з ДНК людини, також вивчається в клінічних умовах. Докторант Аніта Маркс розпочала роботу над людським застосуванням дослідження, для чого дослідники ELTE заклали методологічні основи аналізу з послідовністю нового покоління та побудували за ним систему біоінформатики.

Першим кроком було надання допомоги в лікуванні онкологічних хворих з множинною мієломою. На експериментальній фазі, у тісній співпраці з Центральною лікарнею Південних шкідників, для виявлення ракової клітини, що викликає захворювання, та змін, що виникають в результаті лікування, використовуються зразки крові чи кісткового мозку людини.

Метою є можливість ідентифікувати молекули антитіл у ракових клітинах, присутніх у великих кількостях, шляхом аналізу репертуару антитіл, а потім виявити з високою точністю, навіть точніше, ніж найсучасніші цитометричні вимірювання, серед іншого, коли хіміотерапія або коли пацієнт одужує. Маючи цю інформацію, лікуючі лікарі можуть приймати швидші та надійніші рішення щодо збільшення інтенсивності або взагалі припинення лікування; а також допомогти їм визначити, коли хвороба може повторитися або повністю зникнути з організму. Останні надзвичайно важливі для відповідального та ефективного спостереження пацієнта.

"За допомогою цього методу ми можемо забезпечити, щоб пацієнти з розсіяною мієломою отримували лікування, яке найкраще відповідає їх стану", - резюмувала Маріта Аніта.

Не тільки зараз, але й в рамках інших досліджень, генерується безліч тисяч терабайт даних, які вимагають відповідного біоінформаційного фону для оцінки. "Університет забезпечує методологічну та біоінформатичну основу та дослідницьку роботу, але лікарні підтверджують наші виміри, надають зразки пацієнтів та отримують суттєві відгуки лікарів від повсякденної практики", - підкреслює постійні консультації з лікарями та обширний директор Імре Качковіч FIEK.

Останні результати дослідників ELTE були опубліковані у Frontiers in Immunology, провідному журналі в галузі імунології.