Через десять років після трагедії естонського порому шведський уряд несподівано вирішив замовити нове розслідування причин катастрофи. З’ясувалося, що корабель використовувався для військових перевезень вантажів за тиждень до аварії, і це може бути пов’язано з трагедією.
Наразі теорій змови не бракувало. В ніч на 28 вересня 1994 р. Естонія затонула трохи більше ніж за тридцять хвилин, за шістдесят миль від узбережжя Фінляндії. У хвильовій могилі загинули 852 людини, лише 137 врятувались; це було найгіршим кораблекрушенням в Європі після Другої світової війни. Згідно з офіційним розслідуванням, корабель був у поганому технічному стані, під час шторму восьмиметрові хвилі відірвали зовнішню частину носової частини, а вода залила автостоянку на дні корабля.
На думку експертів, Естонія потонула як шматок каменю. Жодної людини не знайдено, оператор звинуватив суднобудівну компанію, але звинуватив естонську компанію в тому, що вона не підтримує. Рідні загиблих не дуже це оцінили, і розпочато приватне розслідування. Підводні записи виявили, що велика діра в корпусі була спотворена, а аварії з поверхні виявили ознаки вибуху.
Деякі вважали, що корабель також несе військову техніку, включаючи компоненти російської супутникової системи. Імовірно, це було виграно з колишнього радянського запасу естонцями, які нещодавно стали незалежними, і зараз ЦРУ намагається переграти їх. Однак російські агенти однозначно хотіли запобігти потраплянню техніки в руки "ворога" і не цуралися найгіршого (наприклад, вибухового вбивства). За іншою версією, пором також перевозив наркотики, які ввозили наркотики, але коли "принципал" дізнався, що митниця Стокгольма відчула неприємний запах, він "домовився" відкрити зовнішні двері.
Деякі члени сім'ї жертв також стверджували, що їхні близькі спочатку входили до списку врятованих, але зрештою так і не повернулися додому. Близнюки подружжя Вейде, Ганнелі та Ганніка, працювали на кораблі танцюристами. За першими повідомленнями, про них доглядали у шведській лікарні, але врешті-решт їм загубили слід. З тих пір батьки вважають, що вони живі, вони не можуть повернутися додому просто з якихось причин. Другий капітан Аво Піхт був впізнаний кількома знайомими на телевізійних записах про порятунок, але потім він та телевізійні записи зникли.
Шведська слідча комісія, доручена розслідувати причини трагедії, також допомогла розпалити підозру. Виведення затонулої суші на поверхню було категорично відмовлено, а потім вся територія була класифікована як "могила хвиль". Дайвінг навколо корабля було заборонено, видано ордер на арешт журналістів, які його порушили, і нарешті двоє членів комітету подали у відставку, оскільки відчували, що рада хотіла щось прикрити.
Інформація шведського телебачення SVT тепер доводить, що, можливо, припущення, зроблені до цього часу, були не зовсім з повітря. Раніше цього тижня SVT повідомляло, що Естонія щонайменше двічі постачала російську військову техніку. Прес-секретар шведських військових підтвердив інформацію, але заявив, що такого обладнання на борту в ніч катастрофи не було. Прем'єр-міністр Швеції Геран Перссон не виключив: можливо, нове розслідування проллє світло на причини трагедії.