ДИСЕРТАЦІЯ ТЕЗИ ДОСЛІДЖЕННЯ ПРОГНОЗУВАННЯ ГЕНІВ УГОРСЬКОГО MORBUS CROHNOS І УЛЬКЕРОЗУ КОЛІТУ У ХВОРОГО НАСЕЛЕННЯ Університет Лілі Маджарі Печ, Медичний факультет 2007, Медичний факультет, Департамент медичної генетики та розвитку педіатрії
ЗМІСТ 1. Вступ 1.1. Характеристика запальних захворювань кишечника 1.1.1. Хвороба Крона 1.1.2. Виразковий коліт 1.1.3. Порівняння двох захворювань 2. Цілі тесту 2.1. Пошук генетичних варіантів 2.1.1. Ген CARD15 R702W, G908R, 1007FinsC 2.1.2. Ген SLC22A4 C1672T, ген SLC22A5 G-207C 2.1.3. Ген CTLA4 A + 49G 2.1.4. Ген IL23R rs10889677 C/A, rs2201841 T/C, rs1884444 G/T 3. Пацієнти та методи 3.1. Вивчена популяція пацієнтів 3.2. Характеристика фенотипу 3.3. Аналіз генотипу 3.3.1. Ген CARD15 R702W, G908R, 1007finsC 3.3.2. Ген SLC22A4 C1672T, ген SLC22A5 G-207C 3.3.3. Ген CTLA4 A + 49G 3.3.4. Ген IL23R rs10889677 C/A, rs2201841 T/C, rs1884444 G/T 3.4. Статистичний аналіз 4. Результати 4.1. Ген CARD15 R702W, G908R, 1007FinsC 4.2. Ген SLC22A4 C1672T, ген SLC22A5 G-207C 4.3.CTLA4 ген A + 49G 4.4.Ін ген IL23R rs10889677 C/A, rs2201841 T/C, rs1884444 G/T 5. Обговорення результатів та висновки 6. Підсумок результатів 7. Підсумок дисертація 8. Пов’язані публікації 9. Процитовані тези 10. Посилання 11. Подяки 2
СПИСОК СКОРОЧЕНЬ IBD: Запальна хвороба кишечника Назва CD: Хвороба Крона UC: Виразковий коліт SNP: Однонуклеотидний поліморфізм PCR: Полімеразна ланцюгова реакція: Поліморфізм довжини фрагмента рестрикції CARD15: Білок, що містить домен рекрутування каспази, 15 SLC22A4: Сімейство розчинених носіїв 22, член 4 SLC22A5: Розчинене сімейство носіїв 22, член 5 CTLA4: Цитотоксичний ген Т-лімфоцитів 4 ген IL23R: Рецептор інтерлейкіну 23 UTR: Нетранслірувана область EDTA: Етилендіамінтетраоцтова кислота 3
Рисунок 1: Типи виразкового коліту. (www.crohn-colitis.hu) 1.1.3. Порівняння двох захворювань Існує суттєва різниця в тому, в якій частині шлунково-кишкового тракту (рис. 2) 10. Виразковий коліт вражає лише товсту кишку, тоді як хвороба Крона може вражати тонку кишку і товсту кишку, часто можуть бути уражені верхні шлунково-кишкові шляхи як стравохід, шлунок (рис. 2) 10,27,44. Виразковий коліт виникає лише в товстій кишці, тому, якщо стає необхідним видалення товстої кишки, настає постійне лікування 10. На відміну від цього, хвороба Крона може вражати всю травну систему від рота до прямої кишки, тому видалення запаленого відділу не приносить загоєння, хвороба в будь-якому місці може повернутися 10,27,44. Рисунок 2: Кишкові відділи, викликані запаленням від двох захворювань. (www.aloeride.eu/ibd.html) Ще одна важлива відмінність заснована на ураженні стінок кишечника (рисунки 3 та 4) 10. При виразковому коліті запальні явища обмежуються слизовою оболонкою кишечника та підслизовою оболонкою, тоді як при хворобі Крона кишкова стінки всіх шарів, уражених від слизової до серозної оболонки (малюнки 3 та 4) 10,27,43,44. 6
У той час як виразковий коліт викликає запалене запалення, сегментарний, запалений та інтактний кишкові сегменти хвороби Крона чергуються 10. Рисунок 3: Поперечний переріз кишечника, ураженого здоровим (1) та хворобою Крона (2) та виразковим колітом (3), відповідно. та гістологічне зображення. У нижньому рядку показано ендоскопічні зображення. (www.crohn-colitis.hu) Рисунок 4: Шари кишкової стінки. (www.crohn-colitis.hu) У разі хвороби Крона запалення поширюється на більш глибокі шари, настільки, що досягаючи зовнішньої поверхні кишечника, воно може прилипати до сусіднього тонкого або товстого кишкового тракту, органів черевної порожнини (сечового міхура, матка, піхва). аномальний політ між органами, т. зв утворюється внутрішній свищ 10. Кишковий вміст, що містить бактерії, може пройти через свищ у стерильні органи або потрапити у вільну черевну порожнину та спричинити подальші захворювання (наприклад, абсцес). також зовнішній свищ, що утворюється на поверхні шкіри навколо прямої кишки 10. При виразковому коліті ці ускладнення не виникають 10. Коли кишечник запалений, хворий, кишкова стінка не може нормально функціонувати, всмоктувати поживні речовини 10. Це одна з причин того, що запальні кишкові хворі часто недоїдають, 7
анорексичний 10. Типовим симптомом хвороби Крона є втрата ваги 27,44. Якщо хвороба вражає тонку кишку, порушення всмоктування, симптоми гіпотрофії можуть розвинутися 10.44. Навпаки, виразковий коліт, оскільки товста кишка не страждає ні втратою ваги, ні порушенням всмоктування, характерний 10. 8
Цітокін IL-23 та його рецептор були предметом інтересу. IL-23 відіграє важливу роль у вроджених та опосередкованих Т-клітинами запальних процесах у кишечнику 15,20,25,41. Дуерр та ін. IL23R був ідентифікований як ген IBD шляхом дослідження 12 SNP в області гена, деякі з яких схильні до IBD (rs10889677, rs2201841, rs1004819, rs11209032, rs1495965), інші захищають від (rs11209026, rs10489629, rs10489629, rs10489629, rs10489629, rs10489629, rs10489629)), тоді як деякі були байдужими (rs7530511, rs1884444) 12. Ми виділили 3 відмінності, одну в rs10889677 C/A та rs2201841 T/C в 3-й області UTR гена, який схильний до захворювання, а іншу - у rs1884444 Г/Т, що не асоціюється з ВЗК у єврейських та нееврейських груп населення, які вони вивчали 13. 11
4. РЕЗУЛЬТАТИ 4.1. Ген CARD15 R702W, G908R, 1007finsC Ми обстежили 100 дорослих пацієнтів Крона (47 чоловіків, 53 жінки, середній вік: 37,3 року) та 94 клінічно здорових контрольних (47 чоловіків, 47 жінок, середній вік: 45,6 років). Частота мутантних алелів була достовірно збільшився порівняно із популяцією дорослих Крона з контролем дорослих, що також видно на рівні гетерозигот і гомозигот, при цьому 17% дорослої популяції Крона носить обидва або один мутантний алель порівняно з контролем 4,3% (Таблиця 1) 3. Вивчаючи мутації R702W та G908R гена CARD15 у дорослої популяції Крона, ми не виявили відмінностей від контролю дорослих ні на рівні гомозигот, ні в частоті алелів (Таблиця 1) 3. Таблиця 1: Розподіл частоти алелів у варіантах гена CARD15 у дорослих пацієнтів Крона та дорослих контролерів 3. CARD15 генотип R702W G908R 1007фіниC CC CT TT Дорослі пацієнти з хворобою Крона n = 100 87 (87,0%) 12 (12,0%) 1 (1,0%) Дорослий co ntrolls n = 94 87 (92,6%) 5 (5,3%) 2 (2,1%) Частота аллелю T 7,00% 4,79% GG GC CC 94 (94,0%) 6 (6,0%) - 93 (98,9%) 1 (1,16%) - Частота алелів C 3,00% 0,53% 83 (83,0%) 90 (95,7%) вкл. 15 (15,0%) 4 (4,3%) вкл. Вкл. 2 (2,0%) - Частота алелів Cins 9,50% * 2,13% * P