1 Словацьке товариство біохімії та молекулярної біології Інститут молекулярної фізіології та генетики SAS Інститут біохімії, харчування та охорони здоров'я FCFT STU DROBNICOV MEMORIÁL 4-й курс Праці вересень 2007 р.

завантажити

2 проф. Інж. Ovudovít DROBNICA, доктор медичних наук.

3 ЗМІСТ Спогади проф. Інж. Ovudovít Drobnica, DrSc. 2 Оргкомітет 5 Розділ 5 Голова Комісії 5 Члени Комісії 5 Контакт 5 Програма 6 Список афішних робіт 11 Збірник тез 13 Розділ I 13 Розділ II 31 Розділ III 45 Розділ IV 81 Розділ V 83 Повідомлення Розділ 99 Список учасників 124 1

7 ОРГАНІЗАЦІЙНИЙ КОМІТЕТ СЕКЦІЇ Ing. Альберт БРІЄ, доктор медичних наук Доктор філософії Зузана КЛІМЕСОВА Ing. Здена СУЛОВА, к.т.н. док. Інж. Ернест ШТУРДОК, к.с.н. Інж. Дагмар ЗБІЙОВСЬКА, к.т.н. I. Ксенобіотики та взаємозв’язок між будовою та дією речовин II. Біоенергетика та мембранна біологія III. Молекулярна, клітинна біологія та мікробіологія IV. Ензимологія V. Біотехнологія ГОЛОВА КОМІСІЇ ЧЛЕНИ КОМІСІЇ КОНТАКТ проф. RNDr. Яромир Пасторек, доктор медичних наук Інж. Альберт БРІЄ, доктор медичних наук док. RNDr. Мілослав ГРЕКСАК, к.с.н. RNDr. Іван ГАПАЛА, к.с. док. Ольга КРІЗАНОВА, д.т.н. RNDr. Кароль ОНДРІАС, доктор медичних наук RNDr. Сільвія ПАСТОРЕКОВА, доктор медичних наук Інж. Здена СУЛОВА, к.т.н. док. Інж. Ернест ШТУРДОК, к.с.н. Інж. Аттіла ЗІГЕЛЬГОФФЕР, доктор медичних наук Інститут молекулярної фізіології та генетики SAS Vlárska 5, Братислава 3 Тел .: 02/Факс: 02 /

12 21 вересня 2007 р., П'ятниця Сніданок ПОСТ-СЕКЦІЯ Президенти: Сільвія Пасторекова, Здена Сулова, Ернест Штурдік Перерва Лекції-спонсори Засідання Комісії з обіду Оголошення результатів Конкурсу молодих вчених 10

15 Збірник тез Розділ I Ксенобіотики та взаємозв’язок між структурою та дією речовин 13

17 R NH O O 1, NH 2 -O-PS 2, NH 2 -Prot 3, NaBH 4 O R = O-PS, Prot На першому етапі готували кон'югат глюкану та O-PS. Це очищали від реакційної суміші методом гель-проникаючої хроматографії та характеризували за допомогою 1 H-ЯМР-спектроскопії. O-PS зв'язується з 14-48% лінкерів, в результаті чого 4,5-14% O-PS на одиницю мономеру глюкану. Наступним кроком є ​​зв’язування з білками (BSA). Після очищення було встановлено, що вміст білка в отриманому кон'югаті становить 12-22%. Висновок Можна було приготувати кон'югат з великою кількістю вуглеводних епітопів на первинному полісахаридному носії. Крім того, білок був успішно зв’язаний, отримуючи тим самим додаткову конструкцію Т-клітинного епітопу. Отримані матеріали в даний час очікують на використання для подальших досліджень імунологічних властивостей. 1. Ефективна активація карбоксильних полісахаридів для одержання кон'югатів, Паволь Фаркаш та Славомір Бістріки. Карб. Пол., 68, 2007,

21 більш ніж один присутній метал, оцінка, інтерпретація та відображення експериментальних даних набагато складніші, тому ми замінили прості ізотерми на інтерпретацію за допомогою 3D-сорбційних поверхонь. Отримані результати продемонстрували вищу спорідненість іонів Zn 2+ до місць зв’язування на поверхні лишайників та взаємний конкурентний ефект між іонами Zn 2+ та Co 2+ у місцях зв’язування. Висновок: Використання 3D-графічних методів для кількісного опису концентраційних рівноваг сорбції катіонів металів у лабораторних експериментах дозволяє визначити ступінь конкурентного ефекту за наявності інших катіонів, присутніх у розчині, у широкому діапазоні коефіцієнтів взаємної концентрації. Цей підхід також дозволить спостерігати такі конкурентні ефекти, які знаходяться на межі спостережуваності при використанні 2D графічних методів. Інтерпретація результатів із використанням 3D-залежностей також підходить для оптимізації експериментів та більш детального опису впливу декількох незалежних змінних на процеси біосорбції в складних умовах забрудненого природного середовища. Посилання Ho Y.S., Huang C.T., Huang H.W .: Process Biochem., 37 (2002) Lodeiro P., Cordero B., Barriada J.L., Herrero R., Sastre de Vincente M.E.: Bioresour. Technol., 96 (2005) Loppi S., Frati L.: Environment. Моніт. Осі., 114 (2006)

Ундалізація базальної мембрани зародкового епітелію, розширення кровоносних судин в інтерстиції та виникнення пустот в зародковому епітелії, що спостерігаються в яєчках. Зниження відносного обсягу зародкового епітелію, збільшення відносного обсягу інтерстиціального простору, а також збільшення частоти апоптозу вказували на пошкодження інтерстиціалу та виявляли появу набряків. Виміряні нами значення параметрів вказують на те, що ртуть токсично впливає на загальну структуру яєчок і, отже, на перебіг сперматогенезу при заданих концентраціях. Наша робота підтвердила негативний вплив неорганічної форми ртуті на структурно-функціональні параметри нирок та яєчок. 23

27 також знизив активацію Akt-кінази порівняно з контрольним серцем. Дослідження MMP показало, що у серцях щурів, оброблених L-NAME, активність як тканини, так і сироватки MMP-2 знизилася. З іншого боку, у сироватці щурів, оброблених L-NAME, суттєво підвищується желатинолітична активність приблизно. Спостерігали 20 кда протеїнази. Зроблено висновок, що розвиток NOD призвів до інгібування шляхів ERK та Akt-кінази, і ці зміни дозволяють припустити участь цих каскадів у відповідях міокарда на NOD. Результати також вказують на можливий взаємозв'язок між шляхами ERK та Akt-кінази та активацією enos та/або MMP-2. Більше того, знижена вразливість до ішемічної травми у серцях щурів з дефіцитом NO може бути пов’язана з пригніченням експресії inos. Підтримується грантом VEGA 2/6170/27 та APVV

Можна зробити висновок, що кверцетин має кращі антиоксидантні ефекти, ніж рутин, завдяки тому, що він окислюється переважно над рутином. Використовуючи метод CV, суміш обох антиоксидантів було важче відрізнити, що видно з поділу піків, що належать до окремих компонентів. Тому для подальшого вимірювання метод DPV був кращим. Калібрувальні залежності від рутину та кверцетину показані на малюнку 2. Рисунок 1: Порівняння методів вимірювання суміші рутину та кверцетину a.) CV звичайних 1,6 мг/л, кверцетину 0,4 мг/л та b.) DPV звичайних 1,6 мг/л, кверцетин 1,1 мг/л. Рисунок 2: Калібрувальні залежності, виміряні методом DPV кверцетин при -0,04 В проти SCE та рутина при 0,1 В проти SCE. Висновок: Використовуючи вольтамперометричні методи, вдалося відобразити окислювально-відновлювальні властивості рутину та кверцетину, тоді як була розроблена методологія їх паралельного визначення та застосована до аналізу реальних зразків. Ця робота була створена за підтримки проекту VEGA 1/4299/07 та гранту Карлового університету 17 /

33 Розділ II Біоенергетика та мембранна біологія 31

45 іонів Ca 2+. Мінімум був найбільш вираженим для співвідношення співвідношень [Li +]/[Ca 2+] та [Na +]/[Ca 2 12: 1. Коли коефіцієнт концентрації був нижчим, глибина мінімуму зменшувалася. Ми не спостерігали виникнення аномалій залежно від зворотного потенціалу та провідності від молярної частки іонів у сумішах Ba 2+ -Ca 2+ або Cs + -Ca 2+ на просвітній стороні каналу. Бар'єрна модель проникнення іонів через іонний канал вважає наявність аномалій залежно від зворотного потенціалу та провідності від молярної частки ще однією властивістю багатоіонних каналів, але через їх відсутність кількість іонів у провідному шляху не може бути однозначно судженими. З точки зору моделі бар'єру іонної проникності, більш суттєвою властивістю є концентраційна залежність зворотного потенціалу. Вважається, що це одна з характеристик, яка теоретично передбачається лише для багатоіонних каналів. Висновок: Наші результати вперше показують, що канал RyR також має властивості провідності багатоіонних каналів, що послаблює дотепер прийняту гіпотезу про одноіонний характер цього каналу. 43

47 Розділ III Молекулярна, клітинна біологія та мікробіологія 45

55 меншою мірою, ніж S-клітини після короткочасного та тривалого культивування клітин з цисптом. Шляхом імунопреципітації ми визначили, що в лініях MDR L1210 (R, V), культивованих у присутності циспта, кількість Bcl-2 переважає в комплексах Bcl-2/Bax порівняно з L1210 (S). Збільшену кількість білка Bcl-2 (антиапоптотичний білок), зв’язаного в комплексі з Bax (проапоптотичний білок), було виявлено в лініях MDR L1210 після культивування цисптом. Співвідношення цих білків відіграє важливу роль у регуляції апоптозу (2). Ми також визначили рівні білка Bcl-2 та Bax у розчинних та мембранних фракціях, без або в присутності різних концентрацій цисплатину. Висновок: В результаті аналізу МТТ ми виявили, що батьківські клітини L1210, які не експресують P-gp, менш чутливі до збільшення концентрації цисплатину, на відміну від цього, відсоток апоптотичних клітин після інкубації з цисптом значно вищий, ніж у стійких клітин. У той же час ми також виявили відмінності рівнів Bax та Bcl-2 у цитозольній та мембранній фракціях обох типів локусів, а також різні співвідношення обох білків у комплексі Bcl-2/Bax, що свідчить про зміну апоптотичної відповіді у клітинах, що експресують P-gp. Література: 1.-Lamming DW Jr: J. Undergrad. Наук. 3:, Басу і Халдар: Мол. Гул. Вип. 4:, Подяка: Цю роботу підтримали: apvt, vega-2/7122/7 та VEGA 2/080/26. 53

57 призначене розташування. Причиною специфічного розташування кільця, а також основною відмінністю від гомотримерів PCNA є наявність трьох унікальних інтерфейсів, які відрізняються один від одного за фізико-хімічними властивостями. Найбільший інтерфейс з найбільшою взаємодоповнюваністю, кількістю водневих зв’язків та взаємодіями заряду знаходиться між субодиницями PCNA1-PCNA2, що пояснює найнижчий K D (10-11 М), виміряний для цих двох білків [4], а також розташування кілець. Структура димеру PCNA12 має форму V. Порівняння димеру PCNA12 з PCNA12 з гетеротримеру показало різну кривизну димеру PCNA12, а також структурні зміни в інтерфейсах PCNA2-PCNA3 та PCNA1-PCNA3, що свідчить про те, що під час гетеротримеру PCNA123 утворення в димерних клітинах PCNA12 змінюється. Список літератури: 1. Maga, G. & U. Hubscher. J. Cell Sci., P Warbrick, E. Bioessays, (11): p Krishna TS, Phenyo D, Kong XP, Gary S, Chait BT, Burgers P, Kuriyan J. J. Mol Biol 12 серпня; 241. p Dionne I, Nookala RK, Jackson SP, Doherty AJ, Bell SD. Мол. Cell, p Подяка: Ця робота була підтримана грантом МПП від CIHR. Участь у Меморіалі Дробнича 2007 року підтримано грантом Vega 1/4360/07. 55

79 (2 штами S. agalactiae) мали розміри 1095 та 1347 п.н. Секвенування та подальший аналіз BLAST виявили їх зв'язок із сімейством альфаподібних білків. На основі цього дослідження було виявлено велику варіабельність в організації окремих альфа-подібних генів. Через свою мінливість та залежність від географічної приналежності ці гени можуть не бути корисними для виявлення S. agalactiae, але є свідченням біологічної мінливості у цій родині білків. Наявність гена, що кодує білок Sip, було виявлено шляхом мультиплексного ПЛР-скринінгу колекції з 75 ізолятів бичачих S. agalactiae. Для порівняння можливої ​​мінливості в послідовності нуклеотидів гена sip, прямі праймери всередині гена та універсальний зворотний праймер були розроблені та використані в реакційній мультиплексній суміші ПЛР. Цей метод довів високу ідентичність гена sip, а також його специфічність для S. agalactiae. Висновок: Результати цієї роботи підтвердили значну мінливість поверхневих білків S. agalactiae, однак ген sip був специфічним для S. agalactiae і тому корисний для виявлення цього збудника. 77

81 і, провівши скринінг цих сімей за допомогою цієї методики, ми могли б чітко підтвердити діагноз HNPCC. Результати та обговорення: На сьогодні нам вдалося ідентифікувати перші 5 різних довгих генних змін за допомогою методики MLPA (делеція екзону 1-7 у гені hmsh2 у двох непов’язаних особин, делеція екзону 1-3 у гені hmsh2, делеція екзона 1 у гені hmsh2, дублювання екзонів 5-6 у гені hmsh2 та делеція екзонів 5-6 у гені hmh2) у 6 неспоріднених пацієнтів з HNPCC. Отримані результати вказують на той факт, що навіть у нашій популяції тривалі генні зміни можуть суттєво сприяти формуванню HNPCC. Висновок: Ідентифікація цих нових типів мутацій зародкової лінії у підозрілих пацієнтів HNPCC також важлива для родичів, у яких ми тестували на наявність даної тривалої зміни, щоб вибрати групу носіїв мутації та включити їх у спеціальну програму профілактики. Наразі ми працюємо над виявленням місць, де стався розрив і певна частина гена була втрачена. Після успішного впровадження методики на нашому робочому місці, ми допомогли встановити згадану методику для підтвердження тривалих генних змін у генах BRCA1/2 також на кафедрі клінічної генетики Інституту онкології Св. Єлизавети. 79

83 Розділ IV Ензимологія 81

84 Меморіал Дробнікова, 4-й рік, вересень 2007, Кочовце 82

85 Розділ V Біотехнологія 83

101 Розділ пошти 99

103 Результати підтверджують загальне правило, згідно з яким потенційна доступність важких металів до рослин знаходиться у зворотному відношенні до значення реакції ґрунту та суттєво впливає обміном реакції ґрунту (ph/kcl). 101

109 (XG, HEC) у випадку XTH із стебла настурції або з коренів та насіння петрушки залежать від присутності XGO на відміну від XTH із насіння настурції, який гідролізує XG у відсутність XGO (Farkaš et al., 1992 ). XTH, виділені з насіння, мають майже однакову активність, що руйнує полімер, на цих двох донорах при більш високих концентраціях XGO. Висновок: Відмінності в ізоелектричних точках (pi) та специфіці субстрату досліджуваних зразків, виділених з різних частин петрушки та настурції, дадуть інформацію про область досліджень, яка ще не досліджена. Це дослідження було підтримане Словацьким грантовим агентством VEGA No. 2/6133/26 та грантом № II/2/2005 від Словацької академії наук до Центру досконалості GLYCOBIOS. Список літератури: Ait Mohand F та Farkas V. Carbohydr. Рез. 341, 2006, Фаркас В., Айт-Моханд Ф., Стратилова Е. Фізіол рослин. Біохім. 43, 2005, Фаркас В., Сулова З., Стратилова Е., Ганна Р., Маклахлан Г. Арх. Біохім. Біофіза. 298, 1992, Fry S.C., Smith R.C., Renwick K.F., Martin D.J., Hodge S.K., Mathews K.J. Біохім. J. 282, 1992, Iannetta P.M. та Fry S.C Phytochem. Анальний 10, 1999, Nishitani K. Int. Преподобний Цитол. 173, 1997, Sulová Z., Lednická M., Farkaš V. Anal. Біохім. 229, 1995 рік,

117 аналіз кінцевого продукту. Зі збільшенням додавання часникового соку відп. гранульований часник зменшив об’єм та склепіння продуктів. Для поліпшення загальної якості продукції було перевірено придатність застосування аскорбінової кислоти як поліпшувача хлібобулочних виробів. Висновок: Результати показали, що найбільш прийнятними продуктами для оцінювачів були додавання 0,5 та 1% часникового соку та додавання аскорбінової кислоти. Подяки: Робота була підтримана грантами: APVT (), AV (4/0013/07) та APVV (031006). Фіг. 1 Вплив різних концентрацій часникового соку на хід фаринографічних кривих 115

128 КОЧОВЦЕ Садиба та парк використовуються будівельним факультетом Словацького технологічного університету в Братиславі з 1967 року і слугують навчальним кабінетом з можливістю організації конференцій, семінарів, навчання студентів.