метод

Новий метод, який використовував комбінований протеомічний та геномічний підхід до профілювання сироваткових білків у розчині, продемонстрував високу точність у диференціації зразків, отриманих від хворих на рак підшлункової залози, від зразків здорового контролю.

Білковий склад у сироватці крові відображає поточний стан здоров’я людини і за допомогою відповідних інструментів може бути використаний для виявлення ранніх ознак захворювання, таких як рак, що з’являється. Оскільки Світова організація охорони здоров’я (ВООЗ) прогнозувала, що третину всіх видів раку можна вилікувати, якщо діагностувати їх на стадії пухлини I/II, рання діагностика раку значно збільшить шанс на кращий результат для пацієнтів.

У цьому сенсі дослідники з Університету Лунда (Швеція) та їх колеги з біомедичної компанії Immunovia AB (Лунд, Швеція) розробили метод, що поєднує специфічність антитіл із чутливістю послідовності наступного покоління (NGS).

Ця методика ProMIS (скорочення від «Виявлення білка за допомогою мультиплексного імунологічного аналізу в розчині») - це оптимізована платформа для профілювання білків у сироватці крові з масивом мікросфер на основі розчину. В аналізі використовуються фрагменти антитіл (scFvs), спеціально кон'юговані з ДНК-олігонуклеотидними штрих-кодами способом 1: 1, із використанням стратегії сполучення, опосередкованої сортазою А. Штрихові scFvs змішували з білками сироватки. намистини та зв’язані антитіла були виявлені за допомогою NGS, що дозволяє проводити багаторазове та чутливе зчитування.

Працюючи з білками у розчині, нова техніка уникнула властивих технічних проблем, що виникають при звичайних дослідженнях біомаркерів за допомогою біоматриць, таких як плоскі масиви або масиви на основі гранул.

«Роками ми розробляли передові діагностичні методи мультиплексованого аналізу білків сироватки крові з використанням однієї краплі крові з метою ранньої діагностики складних захворювань, зокрема раку. У крові є велика кількість інформації, і наша комбінація протеоміки та геноміки відкриє можливість швидко пов’язати ранній розвиток пухлини з білковими ознаками. Це, в свою чергу, принесе користь пацієнтам з більш сприятливим результатом та загальним виживанням. Ми дуже раді цьому новому інструменту для виявлення біомаркерів наступного покоління », - сказав провідний автор доктор Карл Борребак, професор імунотехнологій з університету Лунда.

Методика ProMIS була описана в інтернет-виданні журналу Nature Communication Biology від 3 липня 2020 року.