Тематичне сховище мікробіомів

сторінки

  • Питання
  • Квитки
  • Проекти
  • Дослідження
  • Засоби
  • Відео
  • Автори
  • Бібліографія

Четвер, 8 лютого 2018 року

4. Чи змінюється мікробіота при сезонному харчуванні?

людини

Рис. 1. Склад мікробної спільноти кишечника Хадза є циклічним і може бути диференційований за сезоном.

(A) Окремі композиції мікробіоти кишечника Hadza у 2013 році - пізно сухий (n = 41, світло-зелений), 2014 рік - ранній вологий (n = 19, фіолетовий), 2014 рік - пізно вологий (n = 58, світло фіолетовий), Підсезони 2014 - ранньо-сухий (n = 30, світло-блакитний) та 2014-пізно-сухий (n = 40, темно-зелений), побудований на незваженому графіку UnoFrac PCoA (ліва панель). Зразки, зібрані в сухий сезон, відрізняються від зразків вологого сезону (P <3 × 10-15 і P <3-16, Wilcoxon), тоді як зразки сухого сезону нечіткі (P = 0,15, Wilcoxon) (права панель)

(E) Лінійний дискримінантний аналіз, підхід під контролем навчання, який використовує лінійну комбінацію характеристик для максимізації поділу класів, успішно відокремлює підрозділи, за винятком сухих сезонів. Довжина та напрямок стрілок вказують на нормовані шкали для кожної з характеристик (OTU).

Отже, дані Hadza показують як збагачення функції основних компонентів раціону протягом сезонів, так і збереження функції протягом двох сухих сухих сезонів. Ми використовуємо ненаправлену метаболоміку, незалежний від послідовності підхід, для створення високомірного "відбитка пальця" функціональності спільноти (26). Ці дані також відмінно диференціювали пори року за допомогою методів навчання без нагляду (рис. S4D), але не розрізняли два посушливих сезони.


Ми дивувались, як наші профілі мікробіоти 350 зразків стільця хадзи, які ми зібрали, порівняно з іншими традиційними та індустріальними групами населення. Ми проаналізували композиційні дані для 18 популяцій з 16 країн, отримані з 26 когорт, використовуючи таксономічні розподіли (Таблиця S5). 18 популяцій було розділено вздовж першої основної координати, що відповідає модернізації (рисунок 3 та рисунки S1 та S6, A та B).
---