коронавірус

Ампаро Толоса, Генотип

Минулого тижня в США було затверджено протокол діагностики зразків слини, який може спростити виявлення інфікованих коронавірусом SARS-CoV-2. Нова система, розроблена в Єльському університеті, використовує зразки слини, які набагато простіше і дешевше отримати, і вимагає меншої кількості реагентів для ідентифікації вірусів.

Основною стратегією стримування коронавірусу COVID-19 є запобігання його передачі від однієї людини іншій. Для цього є два ключові елементи. З одного боку, є відповідальність кожної людини за дотримання заходів соціального дистанціювання та використання маски. З іншого боку, є можливість кожної системи охорони здоров’я швидко виявити заражених та ізолювати їх.

Тести на виявлення коронавірусу мають вирішальне значення для стримування його поширення. Зображення: www.freepik.es

Стандартне виявлення: мазок з носоглотки, екстракція РНК та ПЛР

Поки що найкращим інструментом для виявлення присутності вірусу в людини є взяття зразка носоглотки та проведення ПЛР, широко відома та усталена методика, яка конкретно посилює спадковий матеріал вірусу, доки його не вдасться виявити з інструментами, розробленими для такого ефекту.

Відбір проби для аналізу є важливим етапом, тому рекомендується мазок з носоглотки, який передбачає введення мазка у верхню частину горла. Таким чином збирається матеріал, потенційно заражений вірусом. Згодом проводиться вилучення спадкового матеріалу вірусу (РНК) та його ампліфікація та виявлення.

Ця система має деякі обмеження, оскільки вона вимагає навченого персоналу для проведення мазка та відповідного матеріалу (мазків), крім різних реагентів, високий попит яких може спричинити проблеми з доступністю.

Зразки слини як можливий альтернативний варіант

Для вирішення деяких із цих проблем дослідники з Єльського університету розробили протокол SalivaDirect, який використовує слину замість зразків мазка і виключає етап вилучення РНК. Команда представляє дані про доцільність використання слини в листі, опублікованому в New England of Journal Medicine, де вони показують дані, отримані у 495 безсимптомних медичних працівників, в яких порівнювали результати двох типів зразків, використовуючи звичайні метод екстракції РНК та ПЛР.

З іншого боку, дослідники опублікували розробку SalivaDirect у препринті (стаття ще не розглянута спеціалістами), опублікованій у medRxv. На своєму веб-сайті команда підкреслює, що це не набір, а протокол, який, хоча і спрощує стандартні методи, вимагає, щоб лабораторії, підготовлені для використання в клінічному та діагностичному середовищі.

Додатковою перевагою SalivaDirect є те, що оскільки він є протоколом, тобто набором інструкцій, він був перевірений різними реагентами та пристроями, що робить його досить гнучким щодо наявності матеріалів та приладів у кожній лабораторії. Завданням його розробників є можливість вільно надавати його зацікавленим лабораторіям, щоб вони могли реалізувати його відповідно до його характеристик. Ці лабораторії повинні подати запит на отримання протоколу та після підтвердження, що вони відповідають певним вимогам, вони отримають дозвіл на використання.

Агентство США з контролю за продуктами та ліками (FDA) схвалило використання SalivaDirect як методу виявлення ГРВІ-CoV-2 15 серпня. Це прийняття було перевидано 28 числа.

Команда Єльського університету не сама розробляє стратегії, засновані на тестуванні слини. FDA нещодавно затвердила комерційний тест під назвою DxTerity SARS-CoV-2 RT PCR CE Test, який також використовує цей тип зразків. Інший приклад - команда Хорді Віла з лікарні Клініко де ла Університет Барселони, яка розробила метод аналізу слини, який, як і SalivaDirect, не вимагає вилучення РНК. Результати команди також доступні у препринт-форматі, очікуючи публікації в журналі, який включає експертну перевірку.

Різні скринінгові тести залежно від мети або обсягу

Тести на основі слини мають багато переваг, серед яких виділяється легкість відбору проби (подібна до будь-якого генетичного тесту безпосереднього споживача), що дозволяє уникнути ризику взяти мазок з носоглотки для медичного персоналу. Ті, хто не потребує етапу вилучення РНК, також зменшують обсяг роботи та реагентів, які слід використовувати, що дозволило б проводити більше тестів із меншими економічними витратами. Наразі недоліком є ​​те, що вони менш точні, ніж стандартні ПЛР-тести для виявлення ГРВІ-CoV-2. Це означає, що, хоча в певних контекстах, таких як масивні скринінгові операції, нові тести на зразках слини можуть бути швидким і простим методом для розгляду, в інших ситуаціях, таких як лікарняні умови, традиційні тести продовжуватимуть робити. "Перед випадком чіткого підозри або в лікарні нам потрібен максимально достовірний діагноз, тому ПЛР і надалі використовуватимуть у мазках носоглотки", - пояснив Жорді Віла агенції SINC, "але зразки слини дозволять нам дістати більше людей і більше разів ".

Якщо вам сподобалась ця новина і ви хочете дізнатись більше про генетику в медицині, ви зацікавлені в нашій курси Y Університетська освіта.