Попередження: Ця сторінка є перекладом цієї сторінки оригінально англійською мовою. Зверніть увагу, оскільки переклади генеруються машинами, не те, що всі переклади будуть ідеальними. Цей веб-сайт та його сторінки призначені для читання англійською мовою. Будь-які переклади цього веб-сайту та його веб-сторінок можуть бути неточними та неточними повністю або частково. Цей переклад надається для зручності.

послідовність

¿Чи можете ви дати короткий вступ до азіатської печінки?, Opisthorchis viverrini? Як цей паразит заражає людей?

Opisthorchis viverrini є ендемічним паразитом плоского черв'яка (або печінкової кишки) в Таїланді, Лаоській Народно-Демократичній Республіці, В'єтнамі та Камбоджі. Люди заражаються цим паразитом, коли їдять камбалу, закріплену в неправильно приготованій/консервованій прісноводній рибі.

Після з’їдання личинкова стадія потрапляє в жовчну протоку людини, де переростає у дорослу особину, яка проживає в жовчній протоці протягом декількох років. Дорослі особини виробляють яйця, які проходять через стілець, потрапляють у прісну воду і потрапляють у організм водяного равлика-хазяїна.

Усередині равлики ці паразити переростають у стадію розсіяння, яка залишає равлика та енцистує в м’язі прісноводних риб, закінчуючи їх складний життєвий цикл.

Поточні бюджети свідчать про те, що майже 10 мільйонів людей заражені цими паразитами по всій Південно-Східній Азії.

У людини опісторхоз жовчної протоки викликає, viverrini del O., хвороба, пов’язана зі збільшенням печінки, запаленням печінки та раком печінки (холангіокарцинома; CCA), летальний рак жовчного дерева з дуже поганим прогнозом.

Чи сприяє цей паразит раку печінки?

Opisthorchis viverrini він був класифікований як канцероген класу I. Ми поки не знаємо точних механізмів, що беруть участь, хоча дослідники вважають, що кілька факторів сприяють розвитку раку.

Наприклад, запалення господаря, спричинене пошкодженням клітин або загибеллю клітин, пов’язане з живленням паразитів та/або агрегацією, ймовірно, сприяє канцерогенезу.

Крім того, нещодавні дані свідчать про це viverrini del O. секретують білки, які безпосередньо сприяють росту клітин і розвитку пухлини.

Ще одним фактором, який, як вважають, сприяє пухлинному розвитку, є пошкодження ДНК, спричинене дієтою, багатою нітрозамінами, потужним канцерогеном класу I. Разом ці фактори створюють "ідеальну бурю" в жовчній протоці людини, що призводить до високої захворюваності печінки рак.

Нещодавно було оголошено про сортування геному живої азіатської камбали. Що це означало?

Міжнародна команда, що включає паразитологів та експертів з геноміки з Мельбурнського університету (Австралія), Сінгапурського інституту геному (Сінгапур), Університету Хон Каен (Таїланд) та Пекінського інституту геноміки (Китай), брала участь у послідовності та анотації геномів.

Спочатку ми вилучили геномну ДНК з viverrini del O. і ми використовуємо високопродуктивні машини для секвенування, щоб виготовити обгортку з більш ніж 60 складок геному у вигляді невеликих фрагментів серії. Потім ці невеликі фрагменти були встановлені на риштуваннях геному. У цих великих каркасах геномів визначали та коментували кожну область гена.

Потім було використано ряд інструментів для прогнозування функції кожного гена в viverrini del O., включаючи ключові молекули, пов’язані з метаболізмом та їх адаптацією до життя в жовчній протоці людини.

У чому полягали основні випробування у характеристиці найбільшого на сьогоднішній день генома паразитичного хробака?

Найбільшою проблемою була наявність великої кількості елементів-повторювачів, знайдених в геномній ДНК viverrini del O.

Наприклад, лише 3,4% геному містили генетичні білки, що кодують інформацію. На відміну від цього, більше 30% геному містили повторювані елементи, присутні в більш ніж одному місці в геномі. Це означало, що монтаж був складним.

На щастя, ми змогли використати нове програмне забезпечення (зване Opera), розроблене нашими співробітниками з Сінгапурського інституту геноміки.

Використовуючи оперу, ми створили високоякісний геном повітряного потоку для функціональної анотації фіксованого гена та отримали життєво важливе розуміння фундаментальної молекулярної біології цього паразита, включаючи виявлення основних шляхів, що зв’язують взаємодію черв’як-господар.

Яке розуміння дає це дослідження про те, як камбала виживає в людській жовчній протоці?

Наше дослідження показало, що ці паразити дуже пристосовані до життя в печінці, переносячи їх кількість у жовчній протоці до 10 років.

Наприклад, його viverrini del O. пристосований для виживання в середовищі з низьким вмістом кисню і вміє детоксифікувати шкідливі склади, такі як вільні радикали кисню, що виділяються в жовч під час перекисного окислення ліпідів.

Метаболічні профілі цих паразитів також пропонують пристосування для введення в епітеліальні клітини та/або компоненти жовчі, які багаті на складні ліпіди та білки. Ухилення від імунної відповіді від господаря також важливо для цих паразитів, особливо якщо запалення випливає із клітинного пошкодження, спричиненого інтродукцією та/або агрегацією. Наші дані вказують на те, що кілька секретованих молекул можуть модулювати імунну відповідь господаря.

Чи знайшли ви докази того, що низький вміст білків у цих паразитів змінював тканини людини?

Ми визначили гени, що кодують білки, які інші дослідники показали експериментально для зміни тканин людини. Вважається, що ці молекули (так звані грануліноподібні молекули) імітують фактори росту людини, що сприяють росту клітин.

У нашому дослідженні ми виявили інші неописані грануліноподібні молекули, які також можуть брати участь у регуляції клітини. Зараз досліджується роль цих молекул у сприянні розвитку раку.

Які методи лікування зараз доступні для зараження азіатською печінковою чумкою, і чи можуть їх результати призвести до поліпшення можливостей лікування?

Найпростішою стратегією втручання було б забезпечити, щоб люди сумлінно готували/зберігали рибу, яка використовується для споживання людиною. На жаль, культурна практика споживання сирої риби залишається поширеною у багатьох регіонах, незважаючи на спільні зусилля з просвітництва громад щодо ризиків, пов’язаних із зараженням риб. viverrini del O.

В даний час не існує вакцини для запобігання зараженню, і хіміотерапія покладається на використання одного препарату - празиквантелу.

Недавні дослідження показують, що надмірне використання празиквантелу може знизити ефективність лікування та викликати запалення жовчовивідної системи. Більше того, навіть після успішного лікування, повторне зараження с viverrini del O. це загальноприйняте. Альтернативні стратегії втручання в інфекцію viverrini del O. вони потрібні так терміново.

Геном - важливий ресурс, за допомогою якого можна зрозуміти, як працює препарат або вакцина. Він також може бути використаний для ідентифікації та визначення пріоритетів нових препаратів.

Оскільки цих паразитів важко утримувати в лабораторії, перш ніж проводити дорогу програму скринінгу наркотиків, слід спершу визначити список цільових препаратів.

Який вплив ваш новий ресурс геному справляє на розуміння інших канцерогенних паразитів?

У нашому дослідженні ми включили порівняння геном O. viverrini до a тісно пов'язана печінкова хвороба, Clonorchis sinensis, a ендемічні види у В’єтнамі, Китаї та Південній Кореї та інший паразит, класифікований як канцероген I класу.

Геномне порівняння виявило подібність та відмінності між цими паразитами, включаючи відмінності у виділених грануліноподібних молекулах, які, як вважають, сприяють розвитку раку.

Розуміння біології обох печінкових птахів покращить наше розуміння розвитку раку та допоможе активізувати зусилля по контролю над цими черв'ячними механізмами в Південно-Східній Азії.

Ми також вивчаємо ще одного важливого канцерогенного паразита, Schistosoma haematobium, a кровотоку, який живе в сечостатевих судинах і заражає сотні мільйонів людей на південь від Сахари. Ці паразити сильно відрізняються від viverrini del O., і наш аналіз не виявив жодних загальних генів, пов’язаних з розвитком раку.

Які наступні кроки у вашому дослідженні?

Зараз ми розглядаємо геноми всіх плоских черв’яків та пріоритетні гени для націлювання за допомогою нашого трубопроводу для виявлення наркотиків.

Ми сподіваємось знайти гени/білки, які є загальними для всіх паразитів і на які можна націлити за допомогою існуючих або нових препаратів. Одне з наших важливих завдань - забезпечити лікарів ширшим спектром препаратів для лікування інфекції.

Крім того, ми дослідимо нові сімейства білків, визначені в viverrini del O. уточнити наше розуміння того, як вони можуть жити в жовчній протоці людини протягом декількох років без елімінації імунною системою.

На сьогоднішній день, коли ми характеризуємо новий геном паразитів, ми знаходимо безліч нових білків, які дають нам уявлення про їх унікальні пристосування до людського господаря. Як біологи, ми постійно дивуємось тому, що знаходимо, і раді розгадуванню історії.

Де читачі можуть знайти більше інформації?

Нещодавно ми опублікували геном viverrini del O. та всі наші знахідки в природному спілкуванні (DOI: 10.1038/ncomms5378). Ви також можете дізнатися більше про viverrini del O. на веб-сайті Центрів з контролю та профілактики захворювань (http://www.cdc.gov/parasites/opisthorchis/).

Ніл Янг є державним органом охорони здоров'я, і ​​BGI-Shenzhen фінансує Професор ранньої кар'єри в галузі медичних досліджень Ради (NHMRC) та наші дослідження - Австралійська наукова рада, NHMRC Австралії. Наше дослідження також підтримується попереднім грантом Вікторіанської калькуляції (Grant Life Sciences Number VR0007) на його піковій обчислювальній машині в Університеті Мельбурна, ініціативою уряду Вікторії.

Про доктора Ніла Янга

Він використовує мультидисциплінарний підхід для проведення геномних та молекулярних досліджень для характеристики біології паразитичних плоских червів (клас Trematoda). Вивчаючи цих паразитів, він сподівається краще зрозуміти їх еволюцію в організмі людини та сприяти їх контролю та виведенню.

З моменту підготовки докторантури він провів спільні дослідження, аналізуючи геномні та транскриптомічні дані для характеристики біології широкого кола важливих соціально-економічних паразитів.

Він опублікував> 40 статей або книг у високоякісній міжнародній рецензованій літературі. Поточні проекти, очолювані д-ром Янг, стосуються секвенування геномів канцерогенних паразитів, а також вдосконалення анотацій та сучасних генних наборів з використанням ряду додаткових біоінформаційних підходів.

Квітень Кашен-Гарбутт

Квітень закінчила з першим класом з відзнакою природничі науки в Пембрукському коледжі Кембриджського університету. Під час роботи головним редактором News-Medical (2012-2017) вона розпочала процес виробництва контенту та допомогла збільшити кількість читачів веб-сайтів до понад 60 мільйонів відвідувачів на рік. Під час опитування світових лідерів думок у галузі медицини та наук про життя, включаючи лауреатів Нобелівської премії, Квітень розвинув пристрасть до неврології і зараз працює в Центрі нейронних схем і поведінки в Сайнсбері, що знаходиться в UCL.

Цитати

Будь ласка, використовуйте один із наступних форматів, щоб цитувати цю статтю у своєму есе, роботі чи доповіді:

Кашен-Гарбутт, квітень. (2018, 23 серпня). Послідовність азіатського геному печінкової крихти: інтерв’ю з доктором Нілом Янг. Новини-Медичні. Отримано 07 січня 2021 року з https://www.news-medical.net/news/20140921/Sequencing-the-Asian-liver-fluke-genome-an-interview-with-Dr-Neil-Young.aspx.

Кашен-Гарбутт, квітень. "Послідовність азіатського геному печінкової чумки: інтерв’ю з доктором Нілом Янг". Новини-Медичні. 07 січня 2021 року. .

Кашен-Гарбутт, квітень. "Послідовність азіатського геному печінкової чумки: інтерв’ю з доктором Нілом Янг". Новини-Медичні. https://www.news-medical.net/news/20140921/Sequencing-the-Asian-liver-fluke-genome-an-interview-with-Dr-Neil-Young.aspx. (доступ 7 січня 2021).

Кашен-Гарбутт, квітень. 2018. Послідовність азіатського геному печінкової метелики: інтерв’ю з доктором Нілом Янг. News-Medical, переглянуто 07 січня 2021 року, https://www.news-medical.net/news/20140921/Sequencing-the-Asian-liver-fluke-genome-an-interview-with-Dr-Neil-Young.aspx.

News-Medical.Net надає цю медичну інформаційну послугу відповідно до цих умов. Зверніть увагу, що медична інформація, розміщена на цьому веб-сайті, призначена для підтримки, а не для заміщення стосунків між пацієнтом та лікарем/лікарем та медичної консультації, яку вони можуть надати.

News-Medical.net - Сайт AZoNetwork