Російські вчені місяцями працюють над тривимірною моделлю вірусу, щоб знайти його слабке місце, яке може бути більше у формі, ніж у фоновому режимі
Академгородок - це щось на зразок Силіконової долини російської науки, "академічного міста" часів холодної війни, будівлі якого загублені в гущі сосново-березового лісу в центрі Сибіру. Там, у Новосибірському державному університеті, який має 35 дослідницьких центрів, команда вчених вже кілька місяців працює над тривимірна модель вірусу Зіка у співпраці з Інститутом Вектор, лабораторією високого рівня безпеки, яка славиться криогенними банками штами найбільш смертоносних вірусів на планеті (віспа, Ебола, H5N1 ...).
На чолі розслідування стоїть біолог Анастасія Бакуліна, тривимірний прототип якої допоміг виявити низку подібностей між Зіка та іншими флавівірусами, такі як денге або вірус жовтої лихоманки, які спричиняють понад 50 000 смертей на рік. "Структура атомної роздільної здатності Zika може надати дуже релевантну інформацію про її поведінку", - пояснив російський учений EL MUNDO. "Завдяки аналізу специфічних властивостей поверхневих білків вірусу ми можемо знайти їх слабке місце, тобто область, через яку можна ввести серію мутацій".
Це рішення Зіки може полягати більше у формі, ніж у фоновому режимі вірусу, більш конкретно - в товстому шарі білків на поверхні. Відповідно до їх тривимірної моделі, ключ міг лежати в "плямах унікального амінокислотного складу" поверхневих білків, які утворюють правильну сферичну оболонку і дозволяють вірусу проникати в клітину під час зараження. "Знання того, які частини вірусного білка контактують із клітинною мембраною господаря, і де концентрується найбільша кількість рибонуклеїнової кислоти, є важливим для розробки вакцини".
За словами біолога, досі ніхто не намагався моделювати РНК Зіка. «Ми дуже добре знаємо амінокислотний склад вірусу, але не стільки його просторовий розподіл. Це дуже важливо, оскільки антитіла та інші білки діють відповідно до структури вірусу '. Значна частина його досліджень зосереджена на білок Е, що імітує певні білки векторних комарів роду Aedes щоб прилипати до клітин, саме це робить можливим зараження. "Аналізуючи тривимірну структуру білкового комплексу, ми могли б виявити специфічні властивості його РНК".
Хоча Всесвітня організація охорони здоров'я дозволила чотирьом російським лабораторіям проводити дослідження на Зіка (включаючи Інститут Вектор), в Новосибірському державному університеті вони не мають живих штамів вірусів. «Наш підрозділ зосереджений на роботі з біоінформатики для аналізу структури та клонування нуклеотидних послідовностей вірусних білків. Ми також працюємо з клітинними культурами і намагаємося виділити вірусоподібні частинки ». Розробка остаточної вакцини потребуватиме великої міжнародної співпраці, незважаючи на те, що команда Бакуліної не контактує з жодною лабораторією в США.
Хоча Національний інститут охорони здоров’я в Бетесді за межами Вашингтона вже розпочав перші випробування людини на експериментальній вакцині проти Зіки, Бакуліна стверджує, що в Росії, де було виявлено п’ять випадків зараження, „мета не працювати проти годинник на вакцині, але розробити потужний препарат, який з незначними модифікаціями послідовності може бути використаний у всіх варіантах флавівірусу«. Включаючи вірус, відповідальний за інший тип енцефаліту, дуже поширений в тій зоні Сибіру, який передається через кліщів. «Технологія, яку ми використовуємо, займає більше часу. Тож нам знадобиться щонайменше три роки, щоб отримати першу вакцину, яка, однак, буде набагато ефективнішою ».
Американський інститут алергії та інфекційних хвороб проводить випробування з ДНК-вакциною, яка містить генетичні фрагменти штаму вірусу Зіка, знайденого в Бразилії. "Це досить проста конструкція вакцини, але вона забезпечує занадто слабкий імунітет, головним чином через її нездатність забезпечити гуморальну імунну відповідь". Або іншими словами: «Вони працюють з людьми, поки ми намагаємось змусити бактерії розробити більш природну вакцину з імунологічної точки зору. ДНК-вакцина людини подібна до інструкції IKEA для збирання власне вакцини«.