Лабораторія біомедичної мікробіології та імунології
ХАРАКТЕРИСТИКИ РОБОЧОГО МІСЦЯ
Лабораторія біомедичної мікробіології та імунології (LBMI) була створена 15 березня 1996 року як робоче місце двох організацій - Університету ветеринарної медицини та фармації в Кошице та Інституту нейроімунології Словацької академії наук, які брали участь у створення передового дослідницького підрозділу з імуногеноміки та імунопротеомії.
З моменту свого заснування LBMI забезпечує високий рівень досліджень та освіти. Основна сфера досліджень LBMI полягає у дослідженні взаємодії між хазяїном та нейроінвазивними патогенами, такими як Borrelia burgdorferi, Neisseria meningitidis, Streptococcus pneumoniae, Franciscella, вірус Західного Нілу та вірус кліщового енцефаліту, а також блокування нейрозапалення на ранніх стадіях. Основні дослідницькі заходи спрямовані на: а) вивчення реакції клітин-господарів (утворюючи нервово-судинну одиницю) під час початкової адгезії та проникнення збудника в ЦНС на рівні транскриптома; б) виявлення специфічних лігандних рецепторів та картографування доменів, що беруть участь у зв’язування патогену з рецепторами клітин-господарів;) приготування монодоменних антитіл (sdAbs), які можуть проникати безпосередньо через гематоенцефалічний бар’єр і розпізнавати ліганди патогенів, г) розвиток блокуючих антимікробних пептидів. LBMI також бере участь у проекті COVID-19 APVV щодо виявлення сайтів зв'язування SARS-COV2 та блокування адгезії вірусу до клітин господаря за допомогою sdAbs та противірусних пептидів.
LBMI використовує найбільш інноваційні методи, такі як секвенування РНК (секвенування наступного покоління); «Високоефективні» протеомічні методи з використанням мас-спектрометрії з т.зв. Підходи знизу вгору та зверху вниз; методи виявлення мутацій, такі як SSCP, DGGE, аналізи високої роздільної здатності (HRM); пряме секвенування ДНК; кількісна ПЛР в реальному часі; методи трансфекції; вироблення in vitro рекомбінантних білків; аналізи білково-білкової взаємодії; фаговий дисплей; афінна хроматографія; Висувні тести; культивування клітин, що утворюють гематоенцефалічний бар’єр у людини; і інші.
Наразі 12 докторантів, які займають провідні посади в науково-дослідних інститутах як у Словаччині, так і за кордоном, пройшли навчання в LBMI та пропонували стажування для понад 30 приїжджих дослідників з різних країн зарубіжних країн у галузі прояву фагів та протеоміки.